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本发明涉及一种玉米秸秆资源2,3-丁二醇生产的清洁技术,选用农作物玉米秸为原料,将通过碱法或液化法得到的纤维素原料中的纤维素酶解,接入细菌-克雷伯氏菌属(Klebsiella)或芽孢秆菌属(Bacillus)细菌菌液进行2,3-丁二醇发酵生产,以草代粮、变废为宝,降低了2,3-丁二醇生产成本;废液中只有少量的残留半纤维素、木素和灰分,即使原料水解发酵不完全,废液中固液分离容易,还可再利用,因此减少。