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本发明公开了一种眼镜蛇毒因子和眼镜蛇毒神经毒素的组合分离纯化方法,是首先低温高速离心处理蛇毒原液,再使用3KDa超滤膜除去蛇毒中小分子物质和低分子多肽等,两步层析分别是CM-Sephrose?FF层析柱和Superdex?200凝胶层析柱,在一次生产中分别得到眼镜蛇神经毒素和眼镜蛇毒因子两种有效成分,本发明具有可以同时分离眼镜蛇毒因子和眼镜蛇神经毒素、有效提高了眼镜蛇毒的利用效率、产品纯度高、适合。