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本发明涉及一种以维生素C生产工艺形成的废弃发酵醪液和古龙酸母液生产菌体蛋白和多肽有机肥的方法,属于生物技术与废弃物资源化利用技术领域。在100份维生素C废弃醪液蛋白中添加5-20份古龙酸母液,调解pH值至2.0-5.0,然后,在40-70条件下,经温和水解0.5-12小时。一方面,醪液蛋白中的部分蛋白质被水解,变为成多肽和氨基酸,溶于水中,经调解pH值和适当浓缩,再补加适量微量元素即成为多肽有机肥。