一种大豆叶片特异性启动子SRS4及其应用.pdf

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摘要
申请专利号:

CN201010526255.3

申请日:

2010.11.01

公开号:

CN101979563A

公开日:

2011.02.23

当前法律状态:

终止

有效性:

无权

法律详情:

未缴年费专利权终止IPC(主分类):C12N 15/113申请日:20101101授权公告日:20120111终止日期:20121101|||授权|||实质审查的生效IPC(主分类):C12N 15/113申请日:20101101|||公开

IPC分类号:

C12N15/113(2010.01)I; C12N15/82; A01H5/00

主分类号:

C12N15/113

申请人:

吉林农业大学

发明人:

李海燕; 崔喜艳; 刘晓庆; 张林波; 陈展宇; 宋慧

地址:

130118 吉林省长春市净月开发区新城大街2888号

优先权:

专利代理机构:

长春市四环专利事务所 22103

代理人:

张铁生

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内容摘要

本发明公开了一种大豆叶片特异性启动子SRS4及在转基因植物中的应用,它是用独特设计的引物,以大豆“吉农13”基因组DNA为模板,克隆了大豆rbcS基因启动子SRS4并构建植物表达载体,命名为Pcambia-GrbcSP;采用农杆菌介导的烟草遗传转化,表达GUS基因的方式进行功能验证,从大豆中获得了一种特异性光控启动子,大豆叶片特异性启动子SRS4,可应用于转基因植物,特别是转基因大豆中;为建立植物转基因表达的时、空、量三维调控系统奠定理论基础,对研究基因表达调控、构建基因工程载体、表达目的蛋白、提高产量有着重要的意义。

权利要求书

1: 一种大豆叶片特异性启动子 SRS4, 它的碱基序列如 SEQ ID No.1 所示 ;
2: 权利要求 1 所述的一种大豆叶片特异性启动子 SRS4, 其特征在于 : 它是以大豆 “吉 农 13” 基因组 DNA 为模板, 用下述引物 : SS : 5`-GTGGATGACTCAAGTGCTGG-3` SA : 5`-TCATTGAGGAAGCCATTTGC-3` 通过 PCR 方法扩增获得。
3: 一种含有碱基序列为 SEQ ID No.1 基因的植物表达载体。
4: 一种大豆叶片特异性启动子 SRS4, 在转基因植物中的应用。
5: 一种大豆叶片特异性启动子 SRS4, 在转基因大豆中的应用。

说明书


一种大豆叶片特异性启动子 SRS4 及其应用

    技术领域 本发明属生物技术领域, 确切地说是大豆叶片光控基因 SRS4 启动子及其在转基 因植物中的应用。
     背景技术 大豆为蝶形花科大豆属一年生草本植物, 种子含有丰富的蛋白质, 原产我国, 至今 已有 5000 年的种植史。大豆不仅是重要的食用油脂和蛋白食品原料, 而且是饲养业重要的 蛋白饲料来源, 是我国重要的粮油作物之一。
     我国是大豆生产大国, 但由于我国大豆种植面积减少及食用油消费量的不断增长 和养殖业发展对豆粕需求的增加, 导致我国大豆需求量迅速增加, 如今我国也成为世界最 大的大豆净进口国。
     目前, 利用传统育种, 改良栽培等方法提高大豆产量已陷入瓶颈 ; 因此, 利用基因 工程来获得优质高产和稳产大豆是我国的当务之急。
     植物基因工程研究的主要内容是基因的表达和调控, 但外源基因表达量不足是不 能获得理想转基因植物的重要原因。启动子在决定基因表达方面起着关键作用, 因此选择 合适的植物启动子是增强外源基因表达的首要问题。
     组成型启动子在转基因植物应用中暴露出一些问题, 如: 外源基因在整株植物中 表达, 产生大量异源蛋白质或代谢产物在植物体内积累, 打破了植物原有的代谢平衡 ; 有些 产物对植物并非必需甚至有毒, 因而阻碍了植物的正常生长, 甚至导致死亡。因此, 人们必 需寻找特异性启动子代替组成型启动子, 以更好地调控外源基因表达。
     1, 5- 二磷酸核酮糖羧化 / 加氧酶 (Rubisco) 存在于所有高等植物中, 是光合植 物叶片中含量最丰富的蛋白质, 约占可溶性总蛋白的 50 % ; 也是光合作用中的关键酶。 Rubisco 由 8 个大亚基 (rbcL) 和 8 个小亚基 (rbcS) 组成, 其中由核基因编码的小亚基基因 的表达受光调控, 并具有组织特异性。
     发明内容
     本发明的目的是提供一种大豆叶片特异性启动子 SRS4。
     一种大豆叶片特异性启动子 SRS4, 它的碱基序列如 SEQ ID No.1 所示 ;
     它是以大豆 “吉农 13” 基因组 DNA 为模板, 以
     SS : 5`-GTGGATGACTCAAGTGCTGG-3`SA : 5`-TCATTGAGGAAGCCATTTGC-3` 为 引 物, 通 过 PCR 方法扩增获得。
     一种含有碱基序列为 SEQ ID No.1 基因的植物表达载体。
     本发明另一个目的是, 一种大豆叶片特异性启动子 SRS4, 在转基因植物中的应用, 特别是转基因大豆中的应用。
     本发明一种大豆叶片特异性启动子 SRS4, 是用本发明人独特发计的引物, 以大豆 “吉农 13” 基因组 DNA 为模板, 采用 TAIL-PCR 克隆了大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子 5` 侧翼,根据 TAIL-PCR 所得序列和已知序列设计特异引物, 克隆大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子, 并构 建其植物表达载体, 用农杆菌介导的烟草遗传转化, 表达 GUS 基因的方式进行筛选, 筛出一 种叶片特异性光控启动子 SRS4。
     1, 5- 二磷酸核酮糖羧化 / 加氧酶 (Rubisco) 存在于所有高等植物中, 具有双重 功能, 既能催化 RuBP 与 CO2 形成 3- 磷酸甘油酸的反应, 又能催化 RuBP 与 O2 氧化裂解形成 3- 磷酸甘油酸、 磷酸和磷酸乙醇酸的加氧反应 ; 因此, RuBP 羧化酶是处于光合碳还原和光 合碳氧化两个相反方向但又相互连锁的循环交叉点上, 它的含量和活性变化对植物净光合 效率起着决定性作用 ; 为建立植物转基因表达的时、 空、 量三维调控系统奠定理论基础 ; 对 研究基因表达调控、 构建基因工程载体、 表达目的蛋白、 提高产量有着重要的意义。 附图说明 图 1 为 TAIL-PCR 产物的电泳分析, M: DL2000 ; 1, 2, 3 泳道 : AD2 和特异引物组合所 得的第 1, 2, 3 轮 PCR 产物 ;
     图 2 为大豆 rbcS 启动子 SRS4 的电泳分析, M: DL2000 ; 1: 大豆 rbcS 启动子的 PCR 产物。
     图 3 为重组质粒的 PCR 及酶切鉴定, M: DL2000, 1: 重组质粒的 PCR 鉴定, 2: 重组质 粒的双酶切鉴定。具体实施方式
     实施例 1 提取大豆 “吉农 13” 基因组 DNA
     将大豆 “吉农 13” 种子播在装好砂的营养钵中, 放在 RXZ 型智能人工气候培养箱中 培养。种子出芽前采用暗培养, 出芽后采用 Hoagland 营养液培养, 白天 25℃, 黑夜 16℃, 光 照 16h/d, 光强 3000lx, 相对湿度 75% ; 取生长 2 周的大豆幼苗嫩叶, 按照 AxyPrep 基因组 DNA 小量提取试剂盒进行, 提取大豆 “吉农 13” 基因组 DNA ;
     用紫外分光光度计测定 DNA 在 260nm 和 280nm 处吸光度, 计算 DNA 浓度与纯度, 所 得 DNA 浓度为 OD260/OD280 = 1.865, 纯度为 850ng/μl ;
     实施例 2 大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子 5` 侧翼序列的克隆
     采用 TAIL-PCR 克隆大豆 rbcS 启动子 5` 侧翼序列, 操作程序参照刘耀光等的方 法。
     引物来源 : 依据 NCBI 登录的大豆 RuBP 羧化酶小亚基基因 (SRS4) 编码区上游 DNA 序列 (GeneBank accession : M16889) 设计退火温度较高 (60 ℃ -65 ℃ ) 的 3 个特异引物 SP1, SP2, SP3 ; 经过独特设计的退火温度较低 (40℃ -45℃ ) 的兼并引物 AD2 保存于本实验 室 ( 表 1)。
     表1: 引物及碱基组成
     以大豆 “吉农 13” 基因组 DNA 为模板, 用特异性的巢式引物 SP1、 SP2 和 SP3 分别 与兼并引物 AD2 进行 3 轮 PCR 扩增 ; 将第一轮 PCR 产物稀释 50 倍作第二轮模板, 将第二轮 PCR 产物稀释 100 倍作第三轮模板。
     1%琼脂糖凝胶电泳检测 3 轮 PCR 产物 ( 图 1), 用 DNA 凝胶回收试剂盒回收第三轮 PCR 产物中的单一条带 ; 将回收产物与 pMD18-T 载体连接, 转化 E.coliJM109 感受态细胞, 进行 Amp(100mg/ml)、 IPTG、 X-gal 筛选 ; 挑白色单菌落扩大培养后提取重组质粒, 重组质粒 经 PCR 鉴定后, 将阳性克隆菌液送上海生工测序 ;
     测序结果显示 : 所得序列长度为 867bp, 两侧含有上下游引物, 同时 3` 端序列与已 知序列的 5` 端部分序列完全相同, 表明已成功克隆到大豆 rbcS 启动子 5` 侧翼序列。
     实施例 3 大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子 SRS4(1538bp) 的获得
     根据 TAIL-PCR 所得序列和已知序列设计特异引物 :
     SS : 5`-GTGGATGACTCAAGTGCTGG-3`
     SA : 5`-TCATTGAGGAAGCCATTTGC-3`
     以大豆 “吉农、 13” 基因组 DNA 为模板, 以 SS, SA 为引物扩增目的基因, 经 1%琼脂 糖凝胶电泳检测, 结果显示 : 在约 2000bp 处有单一的特异条带 ( 图 2), 大小与预计理论值 相符。
     用 DNA 凝胶回、 收试剂盒回收 PCR 产物 ; 将纯化产物与 pMD18-T 载体连接, 转化 E.coliJM109 感受态细胞, 进行 Amp、 蓝白斑筛选, 选取重组质粒 PCR 及酶切鉴定 ( 图 3) 均 为阳性的克隆菌液送上海生工测序 ; 测序结果分析显示 : 片段长度为 1538bp, 克隆序列的 部分序列分别与 TAIL-PCR 所得序列、 已知序列部分几乎完全重叠, 表明已成功克隆到大豆 rbcS 启动子序列 ; 其碱基序列如序列表 SEQ ID No.1 所示 ;
     大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子序列分析
     用 DNAman 比对所得大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子序列 (1538bp) 和设计引物的大豆 rbcS 启动子序列 (699bp), 两者相应区域同源性达 97%, 相似性达 45%; 同时也将其与 NCBI 数据库中菜豆 rbcS2 启动子序列、 豌豆的 rbcS 启动子序列相比较, 同源性分别为 73.43%、 33.25% ; 用 PLACE 分析克隆的大豆 rbcS 启动子序列, 发现共有 10 个 GATA 盒 (GATA), 5个 I 盒 (GATAAG), 1 个 GT-1 位点 (GGTTAA), 5 个 GT-1 保守序列 (GRWAAW), 3 个 REalpha 元件 (AACCAA), 这些都是在光诱导表达启动子中的保守元件, 能够调节基因受光诱导后的转录 活性。
     实施例 4
     一、 大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子植物表达载体构建
     根据获得的启动子序列设计引物, 在 SSPAS 5` 端引入 PstI 酶切位点, SSPAA 5` 端 引入 NcoI 酶切位点, 以含大豆 SRS4 启动子的重组质粒为模板进行 PCR 扩增。 PCR 反应条件 : 94℃ 5min ; 94℃ 30s, 60。 ℃ 30s, 72。 ℃ 2min ; 72℃ 10min, 4℃ 15min PCR 扩增, 获得带酶切位 点的启动子序列。 用 PstI/NcoI 双酶切扩增的 PCR 产物和植物表达载体 Pcambia1301, 分别 纯化回收、 连接, 构建大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子的植物表达载体, 命名为 Pcambia-GrbcSP。
     二、 大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子的植物表达载体的功能验证
     1、 农杆菌介导的烟草遗传转化及转基因植株的阳性筛选
     利用三亲杂交法将构建好的植物表达载体 Pcambia-GrbcSP 导入根癌农杆菌菌株LBA4404, 然后侵染烟草种子萌发后 20d 苗龄的叶片外植体 ( 大小 : 0.5cm×0.5cm), 共培养 后用 50mg/L 卡那霉素筛选, 同时以 Pcambia1301 载体作为对照。烟草组织培养、 农杆菌介 导转化、 抗性愈伤组织的筛选及植株再生等实验按参考文献操作, 略有改动。 将获得抗性植 株用 PCR 法进行阳性检测, 引物均为 gus 基因内部引物, 产物大小为 450bp 左右。
     2、 GUS 组织化学分析
     将阳性转基因植株的叶片、 叶鞘、 茎秆、 根, 切成适当大小, 浸入适量的 GUS 染液 中, 37℃过夜, 用 75%酒精脱色, 观察。染色结果发现 : rbcS 启动子只驱动 gus 基因在转基 因植株的叶、 叶鞘中表达, 在茎秆、 根中不表达 ; 而 35S 启动子驱动 gus 基因在整个转基因植 株中都表达。
     3、 转基因植株光诱导表达 GUS 活性检测
     将 PCR 检测的阳性转基因植株在黑暗处培养 6 或 7 天, 取其叶片定量分析 GUS 活 性; 随后将其在正常光照下培养 (16h light, 8h dark) 并在 24h、 48h 和 96h 后分别取其叶 片对 GUS 进行活性分析。
     结果显示, 将在黑暗处培养 6 或 7 天的植株移入正常光照下继续培养时, 其 GUS 活 性明显高于黑暗处培养时的 GUS 活性 ; 而且随着光照时间的延长, GUS 活性也越来越高。 三、 大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子缺失体植物表达载体构建
     根据获得的启动子序列设计引物, 在 SSPAS 5` 端引入 PstI 酶切位点, SSPAA 5` 端 引入 NcoI 酶切位点。以含大豆 SRS4 启动子的重组质粒为模板进行 PCR 扩增目标片段。
     SSPAS1 : 5`-AACTGCAGTCACTGGAACTAACATCTTG-3`
     SSPAS2 : 5`-AACTGCAGAGGCAGTGGCTTCTTATGAG-3`
     SSPAS3 : 5`-AACTGCAGCATCACCTACCATCCCCTTC-3`
     SSPAS4 : 5`-AACTGCAGAACTCCACCACCATCACACA-3`
     SSPAA : 5`-CTAGCCATGGTCATTGAGGAAGCCATTTGC-3`
     PCR 反应条件 : 94℃ 5min ; 94℃ 30s, 60℃ 30s, 72℃ 2min ; 72℃ 10min, 4℃ 15min. PCR 扩 增 获 得 带 酶 切 位 点 的 启 动 子 缺 失 体 序 列, 长度分别为 : 1089bp、 938bp、 712bp 和 334bp。 用 PstI/NcoI 双酶切扩增的 PCR 产物和植物表达载体 Pcambia1301, 分别纯化回收、 连接, 构建大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子缺失体的植物表达载体, 命名为 Pcambia-GrbcSP1、 Pcambia-GrbcSP2、 Pcambia-GrbcSP3 和 Pcambia-GrbcSP4。
     同上方法进行启动子缺失体植物表达载体的功能验证。
     结果表明 :
     1. 在 获 得 的 转 基 因 植 物 中, Pcambia-GrbcSP1、 Pcambia-GrbcSP2、 Pcambia-GrbcSP3 和 Pcambia-GrbcSP4 与 Pcambia-GrbcSP GUS 组织化学分析结果相同。
     2. 定量检测显示 : 在获得的转基因植物中, Pcambia-GrbcSP 驱动的 GUS 活性最高。
     3. 光诱导表达 GUS 活性检测中, Pcambia-GrbcSP 驱动的 GUS 基因大豆 rbcS 基因 光照敏感度最高。
     背景技术 大豆为蝶形花科大豆属一年生草本植物, 种子含有丰富的蛋白质, 原产我国, 至今 已有 5000 年的种植史。大豆不仅是重要的食用油脂和蛋白食品原料, 而且是饲养业重要的 蛋白饲料来源, 是我国重要的粮油作物之一。
     我国是大豆生产大国, 但由于我国大豆种植面积减少及食用油消费量的不断增长 和养殖业发展对豆粕需求的增加, 导致我国大豆需求量迅速增加, 如今我国也成为世界最 大的大豆净进口国。
     目前, 利用传统育种, 改良栽培等方法提高大豆产量已陷入瓶颈 ; 因此, 利用基因 工程来获得优质高产和稳产大豆是我国的当务之急。
     植物基因工程研究的主要内容是基因的表达和调控, 但外源基因表达量不足是不 能获得理想转基因植物的重要原因。启动子在决定基因表达方面起着关键作用, 因此选择 合适的植物启动子是增强外源基因表达的首要问题。
     组成型启动子在转基因植物应用中暴露出一些问题, 如: 外源基因在整株植物中 表达, 产生大量异源蛋白质或代谢产物在植物体内积累, 打破了植物原有的代谢平衡 ; 有些 产物对植物并非必需甚至有毒, 因而阻碍了植物的正常生长, 甚至导致死亡。因此, 人们必 需寻找特异性启动子代替组成型启动子, 以更好地调控外源基因表达。
     1, 5- 二磷酸核酮糖羧化 / 加氧酶 (Rubisco) 存在于所有高等植物中, 是光合植 物叶片中含量最丰富的蛋白质, 约占可溶性总蛋白的 50 % ; 也是光合作用中的关键酶。 Rubisco 由 8 个大亚基 (rbcL) 和 8 个小亚基 (rbcS) 组成, 其中由核基因编码的小亚基基因 的表达受光调控, 并具有组织特异性。
    发明内容
     本发明的目的是提供一种大豆叶片特异性启动子 SRS4。
     一种大豆叶片特异性启动子 SRS4, 它的碱基序列如 SEQ ID No.1 所示 ;
     它是以大豆 “吉农 13” 基因组 DNA 为模板, 以
     SS : 5`-GTGGATGACTCAAGTGCTGG-3`SA : 5`-TCATTGAGGAAGCCATTTGC-3` 为 引 物, 通 过 PCR 方法扩增获得。
     一种含有碱基序列为 SEQ ID No.1 基因的植物表达载体。
     本发明另一个目的是, 一种大豆叶片特异性启动子 SRS4, 在转基因植物中的应用, 特别是转基因大豆中的应用。
     本发明一种大豆叶片特异性启动子 SRS4, 是用本发明人独特发计的引物, 以大豆 “吉农 13” 基因组 DNA 为模板, 采用 TAIL-PCR 克隆了大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子 5` 侧翼,根据 TAIL-PCR 所得序列和已知序列设计特异引物, 克隆大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子, 并构 建其植物表达载体, 用农杆菌介导的烟草遗传转化, 表达 GUS 基因的方式进行筛选, 筛出一 种叶片特异性光控启动子 SRS4。
     1, 5- 二磷酸核酮糖羧化 / 加氧酶 (Rubisco) 存在于所有高等植物中, 具有双重 功能, 既能催化 RuBP 与 CO2 形成 3- 磷酸甘油酸的反应, 又能催化 RuBP 与 O2 氧化裂解形成 3- 磷酸甘油酸、 磷酸和磷酸乙醇酸的加氧反应 ; 因此, RuBP 羧化酶是处于光合碳还原和光 合碳氧化两个相反方向但又相互连锁的循环交叉点上, 它的含量和活性变化对植物净光合 效率起着决定性作用 ; 为建立植物转基因表达的时、 空、 量三维调控系统奠定理论基础 ; 对 研究基因表达调控、 构建基因工程载体、 表达目的蛋白、 提高产量有着重要的意义。 附图说明 图 1 为 TAIL-PCR 产物的电泳分析, M: DL2000 ; 1, 2, 3 泳道 : AD2 和特异引物组合所 得的第 1, 2, 3 轮 PCR 产物 ;
     图 2 为大豆 rbcS 启动子 SRS4 的电泳分析, M: DL2000 ; 1: 大豆 rbcS 启动子的 PCR 产物。
    
    图 3 为重组质粒的 PCR 及酶切鉴定, M: DL2000, 1: 重组质粒的 PCR 鉴定, 2: 重组质 粒的双酶切鉴定。具体实施方式
     实施例 1 提取大豆 “吉农 13” 基因组 DNA
     将大豆 “吉农 13” 种子播在装好砂的营养钵中, 放在 RXZ 型智能人工气候培养箱中 培养。种子出芽前采用暗培养, 出芽后采用 Hoagland 营养液培养, 白天 25℃, 黑夜 16℃, 光 照 16h/d, 光强 3000lx, 相对湿度 75% ; 取生长 2 周的大豆幼苗嫩叶, 按照 AxyPrep 基因组 DNA 小量提取试剂盒进行, 提取大豆 “吉农 13” 基因组 DNA ;
     用紫外分光光度计测定 DNA 在 260nm 和 280nm 处吸光度, 计算 DNA 浓度与纯度, 所 得 DNA 浓度为 OD260/OD280 = 1.865, 纯度为 850ng/μl ;
     实施例 2 大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子 5` 侧翼序列的克隆
     采用 TAIL-PCR 克隆大豆 rbcS 启动子 5` 侧翼序列, 操作程序参照刘耀光等的方 法。
     引物来源 : 依据 NCBI 登录的大豆 RuBP 羧化酶小亚基基因 (SRS4) 编码区上游 DNA 序列 (GeneBank accession : M16889) 设计退火温度较高 (60 ℃ -65 ℃ ) 的 3 个特异引物 SP1, SP2, SP3 ; 经过独特设计的退火温度较低 (40℃ -45℃ ) 的兼并引物 AD2 保存于本实验 室 ( 表 1)。
     表1: 引物及碱基组成
    以大豆 “吉农 13” 基因组 DNA 为模板, 用特异性的巢式引物 SP1、 SP2 和 SP3 分别 与兼并引物 AD2 进行 3 轮 PCR 扩增 ; 将第一轮 PCR 产物稀释 50 倍作第二轮模板, 将第二轮 PCR 产物稀释 100 倍作第三轮模板。
     1%琼脂糖凝胶电泳检测 3 轮 PCR 产物 ( 图 1), 用 DNA 凝胶回收试剂盒回收第三轮 PCR 产物中的单一条带 ; 将回收产物与 pMD18-T 载体连接, 转化 E.coliJM109 感受态细胞, 进行 Amp(100mg/ml)、 IPTG、 X-gal 筛选 ; 挑白色单菌落扩大培养后提取重组质粒, 重组质粒 经 PCR 鉴定后, 将阳性克隆菌液送上海生工测序 ;
     测序结果显示 : 所得序列长度为 867bp, 两侧含有上下游引物, 同时 3` 端序列与已 知序列的 5` 端部分序列完全相同, 表明已成功克隆到大豆 rbcS 启动子 5` 侧翼序列。
     实施例 3 大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子 SRS4(1538bp) 的获得
     根据 TAIL-PCR 所得序列和已知序列设计特异引物 :
     SS : 5`-GTGGATGACTCAAGTGCTGG-3`
     SA : 5`-TCATTGAGGAAGCCATTTGC-3`
     以大豆 “吉农、 13” 基因组 DNA 为模板, 以 SS, SA 为引物扩增目的基因, 经 1%琼脂 糖凝胶电泳检测, 结果显示 : 在约 2000bp 处有单一的特异条带 ( 图 2), 大小与预计理论值 相符。
     用 DNA 凝胶回、 收试剂盒回收 PCR 产物 ; 将纯化产物与 pMD18-T 载体连接, 转化 E.coliJM109 感受态细胞, 进行 Amp、 蓝白斑筛选, 选取重组质粒 PCR 及酶切鉴定 ( 图 3) 均 为阳性的克隆菌液送上海生工测序 ; 测序结果分析显示 : 片段长度为 1538bp, 克隆序列的 部分序列分别与 TAIL-PCR 所得序列、 已知序列部分几乎完全重叠, 表明已成功克隆到大豆 rbcS 启动子序列 ; 其碱基序列如序列表 SEQ ID No.1 所示 ;
     大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子序列分析
     用 DNAman 比对所得大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子序列 (1538bp) 和设计引物的大豆 rbcS 启动子序列 (699bp), 两者相应区域同源性达 97%, 相似性达 45%; 同时也将其与 NCBI 数据库中菜豆 rbcS2 启动子序列、 豌豆的 rbcS 启动子序列相比较, 同源性分别为 73.43%、 33.25% ; 用 PLACE 分析克隆的大豆 rbcS 启动子序列, 发现共有 10 个 GATA 盒 (GATA), 5个 I 盒 (GATAAG), 1 个 GT-1 位点 (GGTTAA), 5 个 GT-1 保守序列 (GRWAAW), 3 个 REalpha 元件 (AACCAA), 这些都是在光诱导表达启动子中的保守元件, 能够调节基因受光诱导后的转录 活性。
     实施例 4
     一、 大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子植物表达载体构建
     根据获得的启动子序列设计引物, 在 SSPAS 5` 端引入 PstI 酶切位点, SSPAA 5` 端 引入 NcoI 酶切位点, 以含大豆 SRS4 启动子的重组质粒为模板进行 PCR 扩增。 PCR 反应条件 : 94℃ 5min ; 94℃ 30s, 60。 ℃ 30s, 72。 ℃ 2min ; 72℃ 10min, 4℃ 15min PCR 扩增, 获得带酶切位 点的启动子序列。 用 PstI/NcoI 双酶切扩增的 PCR 产物和植物表达载体 Pcambia1301, 分别 纯化回收、 连接, 构建大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子的植物表达载体, 命名为 Pcambia-GrbcSP。
     二、 大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子的植物表达载体的功能验证
     1、 农杆菌介导的烟草遗传转化及转基因植株的阳性筛选
     利用三亲杂交法将构建好的植物表达载体 Pcambia-GrbcSP 导入根癌农杆菌菌株LBA4404, 然后侵染烟草种子萌发后 20d 苗龄的叶片外植体 ( 大小 : 0.5cm×0.5cm), 共培养 后用 50mg/L 卡那霉素筛选, 同时以 Pcambia1301 载体作为对照。烟草组织培养、 农杆菌介 导转化、 抗性愈伤组织的筛选及植株再生等实验按参考文献操作, 略有改动。 将获得抗性植 株用 PCR 法进行阳性检测, 引物均为 gus 基因内部引物, 产物大小为 450bp 左右。
     2、 GUS 组织化学分析
     将阳性转基因植株的叶片、 叶鞘、 茎秆、 根, 切成适当大小, 浸入适量的 GUS 染液 中, 37℃过夜, 用 75%酒精脱色, 观察。染色结果发现 : rbcS 启动子只驱动 gus 基因在转基 因植株的叶、 叶鞘中表达, 在茎秆、 根中不表达 ; 而 35S 启动子驱动 gus 基因在整个转基因植 株中都表达。
     3、 转基因植株光诱导表达 GUS 活性检测
     将 PCR 检测的阳性转基因植株在黑暗处培养 6 或 7 天, 取其叶片定量分析 GUS 活 性; 随后将其在正常光照下培养 (16h light, 8h dark) 并在 24h、 48h 和 96h 后分别取其叶 片对 GUS 进行活性分析。
     结果显示, 将在黑暗处培养 6 或 7 天的植株移入正常光照下继续培养时, 其 GUS 活 性明显高于黑暗处培养时的 GUS 活性 ; 而且随着光照时间的延长, GUS 活性也越来越高。 三、 大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子缺失体植物表达载体构建
     根据获得的启动子序列设计引物, 在 SSPAS 5` 端引入 PstI 酶切位点, SSPAA 5` 端 引入 NcoI 酶切位点。以含大豆 SRS4 启动子的重组质粒为模板进行 PCR 扩增目标片段。
     SSPAS1 : 5`-AACTGCAGTCACTGGAACTAACATCTTG-3`
     SSPAS2 : 5`-AACTGCAGAGGCAGTGGCTTCTTATGAG-3`
     SSPAS3 : 5`-AACTGCAGCATCACCTACCATCCCCTTC-3`
     SSPAS4 : 5`-AACTGCAGAACTCCACCACCATCACACA-3`
     SSPAA : 5`-CTAGCCATGGTCATTGAGGAAGCCATTTGC-3`
     PCR 反应条件 : 94℃ 5min ; 94℃ 30s, 60℃ 30s, 72℃ 2min ; 72℃ 10min, 4℃ 15min. PCR 扩 增 获 得 带 酶 切 位 点 的 启 动 子 缺 失 体 序 列, 长度分别为 : 1089bp、 938bp、 712bp 和 334bp。 用 PstI/NcoI 双酶切扩增的 PCR 产物和植物表达载体 Pcambia1301, 分别纯化回收、 连接, 构建大豆 rbcS 基因 SRS4 启动子缺失体的植物表达载体, 命名为 Pcambia-GrbcSP1、 Pcambia-GrbcSP2、 Pcambia-GrbcSP3 和 Pcambia-GrbcSP4。
     同上方法进行启动子缺失体植物表达载体的功能验证。
     结果表明 :
     1. 在 获 得 的 转 基 因 植 物 中, Pcambia-GrbcSP1、 Pcambia-GrbcSP2、 Pcambia-GrbcSP3 和 Pcambia-GrbcSP4 与 Pcambia-GrbcSP GUS 组织化学分析结果相同。
     2. 定量检测显示 : 在获得的转基因植物中, Pcambia-GrbcSP 驱动的 GUS 活性最高。
     3. 光诱导表达 GUS 活性检测中, Pcambia-GrbcSP 驱动的 GUS 基因大豆 rbcS 基因 光照敏感度最高。
    6101979563 A CN 101979568
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1、10申请公布号CN101979563A43申请公布日20110223CN101979563ACN101979563A21申请号201010526255322申请日20101101C12N15/113201001C12N15/82200601A01H5/0020060171申请人吉林农业大学地址130118吉林省长春市净月开发区新城大街2888号72发明人李海燕崔喜艳刘晓庆张林波陈展宇宋慧74专利代理机构长春市四环专利事务所22103代理人张铁生54发明名称一种大豆叶片特异性启动子SRS4及其应用57摘要本发明公开了一种大豆叶片特异性启动子SRS4及在转基因植物中的应用,它是用独特设计的引物,以。

2、大豆“吉农13”基因组DNA为模板,克隆了大豆RBCS基因启动子SRS4并构建植物表达载体,命名为PCAMBIAGRBCSP;采用农杆菌介导的烟草遗传转化,表达GUS基因的方式进行功能验证,从大豆中获得了一种特异性光控启动子,大豆叶片特异性启动子SRS4,可应用于转基因植物,特别是转基因大豆中;为建立植物转基因表达的时、空、量三维调控系统奠定理论基础,对研究基因表达调控、构建基因工程载体、表达目的蛋白、提高产量有着重要的意义。51INTCL19中华人民共和国国家知识产权局12发明专利申请权利要求书1页说明书4页序列表1页附图1页CN101979568A1/1页21一种大豆叶片特异性启动子SRS。

3、4,它的碱基序列如SEQIDNO1所示;2权利要求1所述的一种大豆叶片特异性启动子SRS4,其特征在于它是以大豆“吉农13”基因组DNA为模板,用下述引物SS5GTGGATGACTCAAGTGCTGG3SA5TCATTGAGGAAGCCATTTGC3通过PCR方法扩增获得。3一种含有碱基序列为SEQIDNO1基因的植物表达载体。4一种大豆叶片特异性启动子SRS4,在转基因植物中的应用。5一种大豆叶片特异性启动子SRS4,在转基因大豆中的应用。权利要求书CN101979563ACN101979568A1/4页3一种大豆叶片特异性启动子SRS4及其应用技术领域0001本发明属生物技术领域,确切地说。

4、是大豆叶片光控基因SRS4启动子及其在转基因植物中的应用。背景技术0002大豆为蝶形花科大豆属一年生草本植物,种子含有丰富的蛋白质,原产我国,至今已有5000年的种植史。大豆不仅是重要的食用油脂和蛋白食品原料,而且是饲养业重要的蛋白饲料来源,是我国重要的粮油作物之一。0003我国是大豆生产大国,但由于我国大豆种植面积减少及食用油消费量的不断增长和养殖业发展对豆粕需求的增加,导致我国大豆需求量迅速增加,如今我国也成为世界最大的大豆净进口国。0004目前,利用传统育种,改良栽培等方法提高大豆产量已陷入瓶颈;因此,利用基因工程来获得优质高产和稳产大豆是我国的当务之急。0005植物基因工程研究的主要内。

5、容是基因的表达和调控,但外源基因表达量不足是不能获得理想转基因植物的重要原因。启动子在决定基因表达方面起着关键作用,因此选择合适的植物启动子是增强外源基因表达的首要问题。0006组成型启动子在转基因植物应用中暴露出一些问题,如外源基因在整株植物中表达,产生大量异源蛋白质或代谢产物在植物体内积累,打破了植物原有的代谢平衡;有些产物对植物并非必需甚至有毒,因而阻碍了植物的正常生长,甚至导致死亡。因此,人们必需寻找特异性启动子代替组成型启动子,以更好地调控外源基因表达。00071,5二磷酸核酮糖羧化/加氧酶RUBISCO存在于所有高等植物中,是光合植物叶片中含量最丰富的蛋白质,约占可溶性总蛋白的50。

6、;也是光合作用中的关键酶。RUBISCO由8个大亚基RBCL和8个小亚基RBCS组成,其中由核基因编码的小亚基基因的表达受光调控,并具有组织特异性。发明内容0008本发明的目的是提供一种大豆叶片特异性启动子SRS4。0009一种大豆叶片特异性启动子SRS4,它的碱基序列如SEQIDNO1所示;0010它是以大豆“吉农13”基因组DNA为模板,以0011SS5GTGGATGACTCAAGTGCTGG3SA5TCATTGAGGAAGCCATTTGC3为引物,通过PCR方法扩增获得。0012一种含有碱基序列为SEQIDNO1基因的植物表达载体。0013本发明另一个目的是,一种大豆叶片特异性启动子SR。

7、S4,在转基因植物中的应用,特别是转基因大豆中的应用。0014本发明一种大豆叶片特异性启动子SRS4,是用本发明人独特发计的引物,以大豆“吉农13”基因组DNA为模板,采用TAILPCR克隆了大豆RBCS基因SRS4启动子5侧翼,说明书CN101979563ACN101979568A2/4页4根据TAILPCR所得序列和已知序列设计特异引物,克隆大豆RBCS基因SRS4启动子,并构建其植物表达载体,用农杆菌介导的烟草遗传转化,表达GUS基因的方式进行筛选,筛出一种叶片特异性光控启动子SRS4。00151,5二磷酸核酮糖羧化/加氧酶RUBISCO存在于所有高等植物中,具有双重功能,既能催化RUB。

8、P与CO2形成3磷酸甘油酸的反应,又能催化RUBP与O2氧化裂解形成3磷酸甘油酸、磷酸和磷酸乙醇酸的加氧反应;因此,RUBP羧化酶是处于光合碳还原和光合碳氧化两个相反方向但又相互连锁的循环交叉点上,它的含量和活性变化对植物净光合效率起着决定性作用;为建立植物转基因表达的时、空、量三维调控系统奠定理论基础;对研究基因表达调控、构建基因工程载体、表达目的蛋白、提高产量有着重要的意义。附图说明0016图1为TAILPCR产物的电泳分析,MDL2000;1,2,3泳道AD2和特异引物组合所得的第1,2,3轮PCR产物;0017图2为大豆RBCS启动子SRS4的电泳分析,MDL2000;1大豆RBCS启。

9、动子的PCR产物。0018图3为重组质粒的PCR及酶切鉴定,MDL2000,1重组质粒的PCR鉴定,2重组质粒的双酶切鉴定。具体实施方式0019实施例1提取大豆“吉农13”基因组DNA0020将大豆“吉农13”种子播在装好砂的营养钵中,放在RXZ型智能人工气候培养箱中培养。种子出芽前采用暗培养,出芽后采用HOAGLAND营养液培养,白天25,黑夜16,光照16H/D,光强3000LX,相对湿度75;取生长2周的大豆幼苗嫩叶,按照AXYPREP基因组DNA小量提取试剂盒进行,提取大豆“吉农13”基因组DNA;0021用紫外分光光度计测定DNA在260NM和280NM处吸光度,计算DNA浓度与纯度。

10、,所得DNA浓度为OD260/OD2801865,纯度为850NG/L;0022实施例2大豆RBCS基因SRS4启动子5侧翼序列的克隆0023采用TAILPCR克隆大豆RBCS启动子5侧翼序列,操作程序参照刘耀光等的方法。0024引物来源依据NCBI登录的大豆RUBP羧化酶小亚基基因SRS4编码区上游DNA序列GENEBANKACCESSIONM16889设计退火温度较高6065的3个特异引物SP1,SP2,SP3;经过独特设计的退火温度较低4045的兼并引物AD2保存于本实验室表1。0025表1引物及碱基组成0026说明书CN101979563ACN101979568A3/4页50027以大。

11、豆“吉农13”基因组DNA为模板,用特异性的巢式引物SP1、SP2和SP3分别与兼并引物AD2进行3轮PCR扩增;将第一轮PCR产物稀释50倍作第二轮模板,将第二轮PCR产物稀释100倍作第三轮模板。00281琼脂糖凝胶电泳检测3轮PCR产物图1,用DNA凝胶回收试剂盒回收第三轮PCR产物中的单一条带;将回收产物与PMD18T载体连接,转化ECOLIJM109感受态细胞,进行AMP100MG/ML、IPTG、XGAL筛选;挑白色单菌落扩大培养后提取重组质粒,重组质粒经PCR鉴定后,将阳性克隆菌液送上海生工测序;0029测序结果显示所得序列长度为867BP,两侧含有上下游引物,同时3端序列与已知。

12、序列的5端部分序列完全相同,表明已成功克隆到大豆RBCS启动子5侧翼序列。0030实施例3大豆RBCS基因SRS4启动子SRS41538BP的获得0031根据TAILPCR所得序列和已知序列设计特异引物0032SS5GTGGATGACTCAAGTGCTGG30033SA5TCATTGAGGAAGCCATTTGC30034以大豆“吉农、13”基因组DNA为模板,以SS,SA为引物扩增目的基因,经1琼脂糖凝胶电泳检测,结果显示在约2000BP处有单一的特异条带图2,大小与预计理论值相符。0035用DNA凝胶回、收试剂盒回收PCR产物;将纯化产物与PMD18T载体连接,转化ECOLIJM109感受态。

13、细胞,进行AMP、蓝白斑筛选,选取重组质粒PCR及酶切鉴定图3均为阳性的克隆菌液送上海生工测序;测序结果分析显示片段长度为1538BP,克隆序列的部分序列分别与TAILPCR所得序列、已知序列部分几乎完全重叠,表明已成功克隆到大豆RBCS启动子序列;其碱基序列如序列表SEQIDNO1所示;0036大豆RBCS基因SRS4启动子序列分析0037用DNAMAN比对所得大豆RBCS基因SRS4启动子序列1538BP和设计引物的大豆RBCS启动子序列699BP,两者相应区域同源性达97,相似性达45;同时也将其与NCBI数据库中菜豆RBCS2启动子序列、豌豆的RBCS启动子序列相比较,同源性分别为73。

14、43、3325;用PLACE分析克隆的大豆RBCS启动子序列,发现共有10个GATA盒GATA,5个I盒GATAAG,1个GT1位点GGTTAA,5个GT1保守序列GRWAAW,3个REALPHA元件AACCAA,这些都是在光诱导表达启动子中的保守元件,能够调节基因受光诱导后的转录活性。0038实施例40039一、大豆RBCS基因SRS4启动子植物表达载体构建0040根据获得的启动子序列设计引物,在SSPAS5端引入PSTI酶切位点,SSPAA5端引入NCOI酶切位点,以含大豆SRS4启动子的重组质粒为模板进行PCR扩增。PCR反应条件945MIN;9430S,60。30S,72。2MIN;7。

15、210MIN,415MINPCR扩增,获得带酶切位点的启动子序列。用PSTI/NCOI双酶切扩增的PCR产物和植物表达载体PCAMBIA1301,分别纯化回收、连接,构建大豆RBCS基因SRS4启动子的植物表达载体,命名为PCAMBIAGRBCSP。0041二、大豆RBCS基因SRS4启动子的植物表达载体的功能验证00421、农杆菌介导的烟草遗传转化及转基因植株的阳性筛选0043利用三亲杂交法将构建好的植物表达载体PCAMBIAGRBCSP导入根癌农杆菌菌株说明书CN101979563ACN101979568A4/4页6LBA4404,然后侵染烟草种子萌发后20D苗龄的叶片外植体大小05CM0。

16、5CM,共培养后用50MG/L卡那霉素筛选,同时以PCAMBIA1301载体作为对照。烟草组织培养、农杆菌介导转化、抗性愈伤组织的筛选及植株再生等实验按参考文献操作,略有改动。将获得抗性植株用PCR法进行阳性检测,引物均为GUS基因内部引物,产物大小为450BP左右。00442、GUS组织化学分析0045将阳性转基因植株的叶片、叶鞘、茎秆、根,切成适当大小,浸入适量的GUS染液中,37过夜,用75酒精脱色,观察。染色结果发现RBCS启动子只驱动GUS基因在转基因植株的叶、叶鞘中表达,在茎秆、根中不表达;而35S启动子驱动GUS基因在整个转基因植株中都表达。00463、转基因植株光诱导表达GUS。

17、活性检测0047将PCR检测的阳性转基因植株在黑暗处培养6或7天,取其叶片定量分析GUS活性;随后将其在正常光照下培养16HLIGHT,8HDARK并在24H、48H和96H后分别取其叶片对GUS进行活性分析。0048结果显示,将在黑暗处培养6或7天的植株移入正常光照下继续培养时,其GUS活性明显高于黑暗处培养时的GUS活性;而且随着光照时间的延长,GUS活性也越来越高。0049三、大豆RBCS基因SRS4启动子缺失体植物表达载体构建0050根据获得的启动子序列设计引物,在SSPAS5端引入PSTI酶切位点,SSPAA5端引入NCOI酶切位点。以含大豆SRS4启动子的重组质粒为模板进行PCR扩。

18、增目标片段。0051SSPAS15AACTGCAGTCACTGGAACTAACATCTTG30052SSPAS25AACTGCAGAGGCAGTGGCTTCTTATGAG30053SSPAS35AACTGCAGCATCACCTACCATCCCCTTC30054SSPAS45AACTGCAGAACTCCACCACCATCACACA30055SSPAA5CTAGCCATGGTCATTGAGGAAGCCATTTGC30056PCR反应条件945MIN;9430S,6030S,722MIN;7210MIN,415MINPCR扩增获得带酶切位点的启动子缺失体序列,长度分别为1089BP、938BP、71。

19、2BP和334BP。用PSTI/NCOI双酶切扩增的PCR产物和植物表达载体PCAMBIA1301,分别纯化回收、连接,构建大豆RBCS基因SRS4启动子缺失体的植物表达载体,命名为PCAMBIAGRBCSP1、PCAMBIAGRBCSP2、PCAMBIAGRBCSP3和PCAMBIAGRBCSP4。0057同上方法进行启动子缺失体植物表达载体的功能验证。0058结果表明00591在获得的转基因植物中,PCAMBIAGRBCSP1、PCAMBIAGRBCSP2、PCAMBIAGRBCSP3和PCAMBIAGRBCSP4与PCAMBIAGRBCSPGUS组织化学分析结果相同。00602定量检测显示在获得的转基因植物中,PCAMBIAGRBCSP驱动的GUS活性最高。00613光诱导表达GUS活性检测中,PCAMBIAGRBCSP驱动的GUS基因大豆RBCS基因光照敏感度最高。说明书CN101979563ACN101979568A1/1页70001序列表CN101979563ACN101979568A1/1页8图1图2图3说明书附图CN101979563A。

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