实时微阵列装置及其使用方法 【技术领域】
本发明涉及一种实时微阵列装置。特别地,本发明涉及一种实时PCR微阵列装置。
背景技术
活性微阵列集成有核酸样品制备、片内核酸扩增和微阵列,所述活性微阵列由于其易用性、功能多样性和其他优点而备受关注。活性微阵列普遍地用于首先进行核酸扩增过程,例如聚合酶链式反应(PCR),再继续进行微阵列杂化(或杂交(hybridization))。当目标核酸,例如DNA,浓度很低时,扩增期(uner-amplified)的DNA无法给出足够强的信号用于微阵列检测。在这种情况下,重新测试会导致消耗过多的时间和资源。
【附图说明】
附图并非按比例进行绘制的,在附图中同样的附图标记指示在整个的不同视图中基本上类似的部件。带有不同字母后缀的同一附图标记代表不同示例的基本上类似的部件。附图以示例的方式而非限制性的方式图示出了本申请文件中所讨论的各种实施例,其中
图1示出根据一些实施例的一个实时微阵列装置100的剖面图;
图2示出根据一些实施例的一个实时微阵列装置200的示意图;以及
图3示出根据一些实施例的一个检测目标核酸300的方法的流程框图。
【发明内容】
本发明的实施例涉及到实时微阵列装置,所述装置包括上基板,下基板,定位于所述上基板和所述下基板之间的缓冲区,定位于所述上基板或所述下基板上的微阵列,定位于所述微阵列附近的加热器,定位于所述缓冲区和所述微阵列附近的泵以及定位于所述微阵列附近的成像传感器。
【具体实施方式】
以下的详细描述包括对附图的参考,所述附图构成这些详细描述的一部分。所述附图通过图示的方式示出可以实施本发明的具体实施例。这些实施例,在此处也被称为“实例”,被描述得足够详细,以使本领域技术人员能够实施本发明。在不背离本发明的范围的情况下,这些实施例可以进行组合,也可以采用其他实施例,或是进行结构和逻辑上的改变。因此,以下的详细描述并非一种限制意义,而且本发明的范围通过附加的权利要求及其等同方式来限定。
本申请文件中,除非有特别说明,术语“一个”用于包括一个或者多于一个,而术语“或”用于表示无排他性的“或”。另外,除非进行特别说明,这里使用的短语或术语应当理解为用于描述目的而非限制目的。而且,本申请文件中涉及到的所有出版物、专利和专利文件,全部结合于此作为参考,好像由参考个别地结合而成一样。如果本申请文件和上述被结合的那些参考文件之间出现不一致的用法,被结合的参考中的用法应当被认为是对本申请文件的补充;若出现不相容的不一致,则采用本申请文件中的用法。
本发明的实施例涉及一种实时微阵列装置,所述装置采用加热器来释放在微阵列上扩增期的核酸样品以对其进行再次扩增和进一步地检测。本发明的方法和装置降低了在微阵列上对低浓度核酸进行重复测试(或再测试)的量。微阵列是微小的核酸(例如DNA)附着在固体表面上的位点的集合,形成以表达(整个基因)轮廓(同时监测数千个基因的表达水平)为目的的阵列。复合的核酸扩增和杂化反应(combined nucleic acid amplification and hybridization reaction)可以采用微阵列用以以优化分析。
参考图1,其中示出了根据一些实施例的实时微阵列装置100的剖面图。装置100包括上基板(或上基底)102和下基板(或下基底)104,其可以形成反应室或形成反应室的一部分。扩增区114可支持缓冲区中的核酸扩增过程,例如聚合酶链式反应(PCR)。核酸样本可以在微阵列110上进行杂化(或杂交)。缓冲区能支持扩增过程和杂化过程。箭头112可以代表扩增区114和微阵列110之间的分隔,或者可以指示核酸运动机构,例如泵。可将成像传感器106定位于所述微阵列110附近。所述成像传感器106可以是例如CCD相机。可将加热器108定位于所述微阵列110附近。也可将所述加热器108定位于例如扩增区附近。可以利用泵来完成核酸样本在反应室内或扩增区114和微阵列110之间的运动,所述泵例如是气动泵、步进马达泵或静电泵。也可;利用例如电润湿或光电润湿来实现样本地移动。
所述加热器108可以包括多个加热器或加热器的多个部分(或零部件),它们能够维持各单独的温度。例如,加热器可定位(或设置)成在一个温度(例如,约90℃及以上)下使扩增期的核酸变性,在反应室的单独部分内,一单独的加热器或单个加热器的一部分可加热到一个较低的温度(例如约60℃)来韧化(或退火)或杂化(anneal or hybridize)。
所述基板(上基板102和下基板104)可以由光学材料组成,例如由玻璃或聚合物制成。核酸样本,或目标核酸,可以是例如DNA、RNA或DNA和RNA。加热器108可以是例如导线、加热板、或利用热空气或辐射热。所述加热器108可定位于例如反应室内,集成在反应室的内部结构中或定位于反应室外。
参考图2,其中示出根据一些实施例的一个实时微阵列装置200的示意图。基板202可支持例如微阵列204。加热器206可定位于所述微阵列204附近。所述加热器206可定位于例如微阵列204的下方或微阵列附近一个充分的距离,以影响杂交温度。
参考图3,其中示出根据一些实施例的检测目标核酸300的方法的流程框图。在步骤302,可对微阵列进行分析,以充分识别任何扩增期的核酸样本。在步骤302的分析例如可以通过评价由用光接触所述微阵列而产生的信号来完成。例如,当用迅衰波(或衰减波)接触所述微阵列时可能会产生荧光信号。通过在步骤304启动加热器来释放扩增期的核酸样本。在步骤304,所述核酸样本可以通过在韧化温度例如约90℃及以上的温度变性而得到释放。在步骤306,所述核酸样本可以在所述缓冲区再次得到扩增,而后,在步骤308,在所述微阵列上再次进行杂化。之后,在步骤310,所述微阵列可被再次分析。
摘要按照37C.F.R.§1.72(b)的规定提供,使得读者能快速确定本专利申请的内容的性质和要点。应当理解,提交的摘要并非用于对权利要求的范围和含义的解释和限制。