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本发明提供了一种去除制备中性氨基酸的反应体系中的丙氨酸的方法,其中制备中性氨基酸的反应体系为采用转氨酶法或发酵法制备中性氨基酸的反应体系。本发明提供的方法为向上述反应体系中加入丙氨酸消旋酶和能专一性催化单一手性氨基酸发生进一步反应的催化剂,从而特异性地去除上述反应体系中的丙氨酸。使用本发明提供的方法,可特异性地去除转化液或发酵液中的丙氨酸,从而简化了中性目标氨基酸的分离纯化和精制工艺。。