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本发明公开了一种快速筛选高烟碱烟草突变体的方法,属于生物技术领域。包括以下步骤:1)将烟草M2代种子点播在茉莉酸甲酯水溶液上,2)15天后筛选根长显著受抑制的单株,3)将步骤2)筛选出的单株移到MS营养液中培养20天,4)将步骤3)的烟株移到含营养土的假植盘中,30天后将其移栽大田,5)大田种植,常规管理6)在三个不同时间点测定烟碱含量7)自交收种。本发明在20天内完成了4000份中烟100突变体。