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1、(10)申请公布号 CN 104004804 A (43)申请公布日 2014.08.27 CN 104004804 A (21)申请号 201310059456.0 (22)申请日 2013.02.26 CCTCC NO: M 2011292 2011.08.19 C12P 21/02(2006.01) C12R 1/465(2006.01) (71)申请人 长沙天赐生物医药科技有限公司 地址 410330 湖南省长沙市国家生物产业基 地科技创业中心 8302 室 申请人 长沙慈航药物研究所有限公司 哈药慈航制药股份有限公司 (72)发明人 段燕文 沈奔 朱湘成 杨虎 (74)专利代理机构 。
2、长沙正奇专利事务所有限责 任公司 43113 代理人 马强 (54) 发明名称 一种博来霉素族衍生物的微生物发酵制备方 法 (57) 摘要 本发明涉及生物医药技术领域, 具体涉及 一种博来霉素族衍生物的微生物发酵制备方 法, 该方法是通过培养 SB9026( 保藏号 CCTCC M2011292) 发酵用菌株、 选择合适的种子培养基 和发酵培养基和培养条件, 在此基础上, 在发酵罐 中对上述微生物发酵制备方法进行中试放大, 通 过对温度、 转速、 pH 值控制及原料补充控制等调 控手段来调试和建立放大规模的新型活性博莱霉 素衍生物6 -脱羟基-BLM S的微生物发酵制备工 艺。该制备方法缩短 。
3、6 - 脱羟基 -BLM S 的发酵 制备周期, 提高 6 - 脱羟基 -BLM S 的发酵产率 , 同时增加了 6 - 脱羟基 -BLM S 在总代谢产物中 的比例, 便于后继的分离提纯。 本发明的博来霉素 族衍生物其化学结构通式如说明书中所示。 (83)生物保藏信息 (51)Int.Cl. 权利要求书 2 页 说明书 13 页 附图 1 页 (19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 权利要求书2页 说明书13页 附图1页 (10)申请公布号 CN 104004804 A CN 104004804 A 1/2 页 2 1. 一种博来霉素族衍生物的微生物发酵制备方法, 所述博。
4、来霉素族衍生物为 6 - 脱羟 基 -BLM S, 其特征是, 具体步骤为 : 1) 黄绿链霉菌 SB9026 的发酵培养 : 将黄绿链霉菌 SB9026 菌株接种至种子培养基中培养, 在 25 C-35下培养 1-3 天 ; 再取所述种子培养基转接到发酵培养基中培养, 接种量为 8%-12%, 在 25 C-35下培养 9-10天 ; 所述种子培养基为 : 12g/L-17g/L甘油、 12g/L-17g/L棉籽粉、 2.5g/L-3.5g/L NaCl 和 4.5g/L-5.5g/L 蛋白胨, 其余为水, pH 值为 6.8-7.2 ; 所述发酵培养基为 : 18g/L-22g/ L 葡萄。
5、糖, 12g/L-17g/L 可溶性淀粉, 18g/L-22g/L 黄豆粉, 4.5g/L-5.5g/L 酵母粉, 0.08g/ L-0.12g/L CuSO4 5H2O, 0.48g/L-0.52g/L ZnSO4 7H2O和2.5g/L-3.5g/L CaCO3, 其余为水, pH 为 6.8-7.2 ; 其中黄绿链霉菌 SB9026 的保藏号为 CCTCC M 2011292 ; 2) 发酵罐发酵制备博来霉素族衍生物 : 采取逐级放大的方式将所述发酵培养基转接至发酵罐中发酵培养 ; 所述发酵罐培养时 采取梯度降温模式, 初始温度为 32 C, 当发酵罐培养至 20-26 小时降温至 30。
6、; 当发酵罐 培养至55-65小时时降温至28C, 继续发酵培养115-125小时 ; 在发酵培养过程中对微生 物的生长和次代谢产物的合成进行控制, 同时通过在线监测 pH 值和溶氧值, 使发酵液中残 糖浓度维持在 0.8g/L-1.2g/L, 同时 pH 值维持在 7.5 以下, 溶氧维持在 40%-60%, 发酵周期 为 6-12 天 ; 6 - 脱羟基 -BLM S 在发酵液中的产量达 30mg/L 以上。 2. 根据权利要求 1 所述博来霉素族衍生物的微生物发酵制备方法, 其特征是, 在步骤 1) 发酵培养之前先对黄绿链霉菌 SB9026 进行涂布培养, 筛选高产菌株。 3. 根据权利。
7、要求 1 或 2 所述博来霉素族衍生物的微生物发酵制备方法, 其特征是, 步 骤 1) 为 : 将黄绿链霉菌 SB9026 菌株接种至种子培养基中培养, 在 30下培养 2 天 ; 再取 所述种子培养基转接到发酵培养基中培养, 接种量为 10%, 在 30 C 下培养 12 天 ; 所述种 子培养基为 : 15gL 甘油、 15g/L 棉籽粉、 3g/L NaCl 和 5g/L 蛋白胨, 其余为水, pH 值为 7.0 ; 所述发酵培养基为 : 20g/L 葡萄糖, 15g/L 可溶性淀粉, 20g/L 黄豆粉, 5g/L 酵母粉, 0.1g/L CuSO45H2O, 0.5g/L ZnSO4。
8、7H2O 和 3g/L CaCO3, 其余为水, pH 值为 7.0。 4.根据权利要求1或2所述博来霉素族衍生物的微生物发酵制备方法, 其特征是, 步骤 2) 中所述逐级放大的方式具体为 : 先将 300l 黄绿链霉重组工程菌 SB9026 的孢子悬浮液 接种到 60ml 种子培养基中进行第一级放大, 在 32 C 下培养 24 小时后转至 600ml 发酵培 养基中进行第二级放大, 并在 32 C 再次培养 24-36 小时直至菌丝体密度达到肉眼可见密 集程度 ; 随后将所述600ml发酵培养基转接至装有6L发酵培养基的15L发酵罐中进行发酵 培养。 5.根据权利要求1或2所述博来霉素族衍。
9、生物的微生物发酵制备方法, 其特征是, 步骤 2) 中发酵罐培养的具体方法为 : 当发酵罐的容积为 12L-20L 时, 发酵罐开始培养时, 初始温 度为32C ; 初始pH值为6.8 ; 设置发酵罐溶氧值与转速为联动状态, 溶氧的下限值为30%, 转速范围为 210rpm-400rpm ; 当发酵罐培养至 20-26 小时, 设置发酵罐溶氧值与转速为联动 状态, 将培养温度降低至30C ; 当发酵罐培养至55-65小时, 发酵液溶氧值跌至最低, 转速 在最高值运转, 此时将培养温度进一步降低至 28 C ; 在发酵培养后期约 115-125 小时, 发 酵液溶氧值和 pH 值开始上升时, 开。
10、始补加葡萄糖溶液, 并实时测定发酵液中残留的还原糖 浓度, 通过调节补料的频率和速度以及葡萄糖溶液的浓度, 使发酵液中残糖浓度维持在 1g/ 权 利 要 求 书 CN 104004804 A 2 2/2 页 3 L, 同时 pH 值维持在 7.5 以下, 溶氧在 40%-60% ; 当发酵罐维持补充葡萄糖 2-3 天, 溶氧和 pH 值开始进一步上升, 此时整个发酵周期结束。 权 利 要 求 书 CN 104004804 A 3 1/13 页 4 一种博来霉素族衍生物的微生物发酵制备方法 技术领域 0001 本发明属于生物医药技术领域, 具体涉及一种新型博来霉素族衍生物的微生物发 酵制备方法。。
11、 背景技术 0002 博 莱 霉 素 (Bleomycin, 英 文 简 字 BLM)是 20 世 纪 60 年 代 从 轮 枝 链 霉 菌 (Streptomyces verticillus) 的发酵产物中分离发现的一类糖肽类抗肿瘤抗生素。目 前已有十余种博莱霉素天然组分被发现, 它们的结构仅在末端胺基上存在差异, 其中主要 成分为博莱霉素 A2(55 70) 和博莱霉素 B2(25 32) 。此外, 包括泰莱霉素 (Tallysomycin) , 佐伯霉素 (Zorbamycin) 和腐草霉素 (Phleomycin) 在内的天然产物与博 莱霉素的结构和活性都极为相似, 因此统称为博莱霉素。
12、族糖肽类抗肿瘤抗生素。 0003 博莱霉素有独特的分子结构和生物活性, 能够介导激活氧分子, 并选择性地引起 单链和双链DNA的断裂从而抑制肿瘤细胞DNA合成和复制。 此外, 博莱霉素还可以选择性地 裂解 RNA 从而抑制蛋白质的合成。博莱霉素的活性机理决定了其不会抑制骨髓造血系统和 免疫系统, 因此对人体白细胞, 机体免疫功能和造血系统等的副作用较为轻微。 博莱霉素属 于细胞周期非特异性药物, 从上世纪 80 年代起被开发成为一种重要的有效抗肿瘤药物, 在 临床上广泛应用。以 BLM A2 和 B2 为主要成分的商品药就被用于治疗睾丸癌, 同时还广泛应用于霍奇金淋巴瘤、 鳞状上皮细胞癌、 生。
13、殖细胞瘤和其他肿瘤的治疗。 但是博 莱霉素能增加活性氧分子从而导致细胞的氧化压力, 并诱导肺中的上皮和非上皮细胞的衰 老和凋亡最终导致肺纤维化。目前博来霉素一般与其他抗肿瘤药物或辅助药物联合应用, 以降低其毒性和获得更好的抗肿瘤效果。 0004 佐 伯 霉 素 (Zorbamycin,英 文 简 字 ZBM)是 由 黄 绿 链 霉 菌 (Streptomyces flavoviridis) 合成的博莱霉素族抗生素。 佐伯霉素与博莱霉素在结构极为相似, 主要差别 在于佐伯霉素中的末端胺基支链不同, 第一个噻唑啉 / 噻唑的氧化程度不同, 多肽骨架中 存在 - 羟基化 -L- 缬氨酸和 L- 高丝。
14、氨酸结构部分, 糖基部分为 2-O-(3-O- 氨基甲酰 - 甘 露糖基 )-6- 脱氧 -L- 古洛糖 (如式 II 所示) 。相应的, 在佐伯霉素生物合成基因簇 (zbm) 的 40 个开放阅读框 (ORF) 中, 仅有 22 个显示出与对应的博莱霉素生物合成基因簇 (blm) 开放 阅读框的同源性, 其 它开放阅读框的不同很可能导致了上述两种化合物的结构差异。 0005 博莱霉素自被发现后便因其强效的抗肿瘤活性迅速成为治疗多种肿瘤的特效化 疗药物, 近年来博莱霉素族抗生素在抗病毒研究中的应用, 更加拓宽了其应用范围。 但是博 莱霉素导致的剂量依赖性肺纤维化以及一些肿瘤细胞逐渐形成的耐药性。
15、极大地限制了其 临床应用和推广。 因此合成新型的高效低毒的博莱霉素族衍生物一直都是开发博莱霉素类 抗肿瘤药物的关键和热点。虽然博莱霉素的化学全合成已经完成, 但是通过传统化学修饰 获取的少量博莱霉素衍生物并未展示出更好的活性或更低的毒性, 同时博莱霉素及其复杂 的分子结构也导致相关的合成过程繁琐且效率低下, 无法满足临床研究的需要和工业化生 产的应用。随着生物化学和分子生物学的快速发展, 新兴的组合生物合成方法通过遗传操 说 明 书 CN 104004804 A 4 2/13 页 5 纵次代谢产物生物合成基因来获取目标天然产物衍生物, 是一种非常有应用前景的高新技 术。通过生物合成基因簇中蕴含。
16、的信息以及相关微生物的遗传操纵, 组合生物合成技术可 实现复杂结构的多功能团化合物的特定结构改变。 另一方面, 包括博莱霉素、 泰莱霉素和佐 伯霉素在内的几种博莱霉素族抗肿瘤抗生素的生物合成被大量研究, 其相关生物合成基因 簇已经被分别克隆、 测序以及表征, 这为我们通过组合生物合成技术来操纵这些生物合成 器并获得具有更好抗肿瘤活性和更低毒性的新型博莱霉素衍生物提供了坚实的基础, 也为 最终的博莱霉素类新型抗肿瘤药物的开发提供了一条新颖高效的途径。 0006 0007 式 II.、 博莱霉素 (BLM) 和佐伯霉素 (ZBM) 的化学结构, 红色虚线圈标示为两者结 构差异之处。 0008 虽然。
17、博莱霉素类化合物具有强效的抗肿瘤活性, 要推广其在临床上的应用就必须 面对和解决博莱霉素诱导的剂量依赖性肺纤维化以及一些肿瘤细胞逐渐形成的耐药性等 关键性问题, 因此合成新型的高效低毒的博莱霉素族衍生物一直都是开发博莱霉素类抗肿 瘤药物的关键和热点。 博莱霉素复杂的分子结构使得通过传统的化学全合成方法来获取其 相关衍生物的过程及其繁琐且效率低下, 无法满足临床研究的需要和工业化生产的应用, 并且合成的博莱霉素衍生物也并未展示出更好的活性或更低的毒性。 新兴的组合生物合成 方法 通过遗传操纵次代谢产物生物合成基因来获取目标天然产物衍生物, 是一种非常有 应用前景的高新技术。专利申请号 20111。
18、0276318.9, 从佐伯霉素的原始高产菌株黄绿链霉 菌 SB9001 出发, 应用基因重组技术将黄绿链霉菌 SB9001 中的 zbmVIII 基因完全失活后得 到不生产佐伯霉素的黄绿链霉菌突变株, 然后以该突变株作为异源宿主, 将包含完整博莱 霉素生物合成基因簇 (blm 基因簇) 的人造细菌染色体质粒 blm1-6E 转入其中获得黄绿链霉 菌重组工程菌 SB9026 (保藏号 CCTCC M 2011292) 。从该重组工程菌的发酵培养产物中我们 成功得到一种新型博莱霉素衍生物 6 - 脱羟基 -BLM S, 并且初步生物活性测试表明 6 - 脱 羟基 -BLM S 的 DNA 裂解活。
19、性至少是博莱霉素 -A2 的 10 倍以上。这说明在更少用量的条件 下, 6 - 脱羟基 -BLM S 比目前临床使用的任何一种博莱霉素类抗癌药物的毒性都要低, 因 此作为迄今为止发现的最有效的博莱霉素衍生物, 6 - 脱羟基 -BLM S 很有希望成为博莱霉 素族化合物中的新型抗癌药物。但是, 6 - 脱羟基 -BLM S 在黄绿链霉菌重组工程菌 SB9026 中的发酵产率极低, 并且还有伴随的副产物 BLM S 产生, 两者产量相当, 总产量仅为 10mg/ L 左右, 其中 6 - 脱羟基 -BLM S 为 5mg/L 左右, 同时整个发酵制备周期在 12 天以上, 效率 低下。 而要推。
20、动其后继的抗癌活性分析、 作用机理以及临床前期等研究, 就必需获得足量的 6 - 脱羟基 -BLMS。因此, 无论是从现阶段研究的需要, 还是将来工业化应用的需求, 如何建 说 明 书 CN 104004804 A 5 3/13 页 6 立一套稳定并且高效高产的 6 - 脱羟基 -BLM S 的微生物发酵制备方法都迫在眉睫。 发明内容 0009 针对以上现有技术的不足, 本发明提供了一种利用黄绿链霉重组工程菌 SB9026 来高效合成新型活性博莱霉素衍生物的微生物发酵制备方法。 具体是通过单一菌落分离和 菌种选育筛选出稳定高产的 SB9026 发酵用菌株, 然后通过多组平行摇瓶实验, 采取单因。
21、素 和多元响应面等方法来优化发酵制备时所需的种子培养基和发酵培养基, 并最终确定使微 生物的生长和合成条件达到协调性最佳的培养基。在此基础上, 在 15L 发酵罐中对上述微 生物发酵制备方法进行中试放大, 通过对温度、 转速、 pH 值控制及原料补充控制等调控手段 来调试和建立放大规模的新型活性博莱霉素衍生物 6 - 脱羟基 -BLM S 的微生物发酵制备 工艺, 缩短 6 - 脱羟基 -BLM S 的发酵制备周期, 提高 6 - 脱羟基 -BLM S 的发酵产率。 0010 本发明的技术方案是 : 0011 一种博来霉素族衍生物的微生物发酵制备方法, 所述博来霉素族衍生物为 6 - 脱 羟基。
22、 -BLM S, 具体步骤为 : 0012 1) 黄绿链霉菌 SB9026 的发酵培养 : 0013 将黄绿链霉菌 SB9026 菌株接种至种子培养基中培养, 在 25 C-35下培养 1-3 天 ; 再 取所述种子培养基转接到发酵培养基中培养, 接种量为 8%-12%(体积比) , 在 25 C-35下培养 9-10 天 ; 所述种子培养基为 : 12g/L-17g/L 甘油、 12g/L-17g/L 棉籽粉、 2.5g/L-3.5g/LNaCl 和 4.5g/L-5.5g/L 蛋白胨, 其余为水, pH 值为 6.8-7.2 ; 所述发酵培养 基为 : 18g/L-22g/L 葡萄糖, 1。
23、2g/L-17g/L 可溶性淀粉, 18g/L-22g/L 黄豆粉, 4.5g/L-5.5g/ L 酵母粉, 0.08g/L-0.12g/L CuSO45H2O, 0.48g/L-0.52g/L ZnSO47H2O 和 2.5g/L-3.5g/ LCaCO3, 其余为水, pH 为 6.8-7.2 ; 其中黄绿链霉菌 SB9026 的保藏号为 CCTCC M 2011292 ; 0014 2) 发酵罐发酵制备博来霉素族衍生物 : 0015 采取逐级放大的方式将所述发酵培养基转接至发酵罐中发酵培养 ; 所述发酵罐培 养时采取梯度降温模式, 初始温度为 32 C, 当发酵罐培养至 20-26 小时。
24、降温至 30; 当发 酵罐培养至55-65小时时降温至28C, 继续发酵培养115-125小时 ; 在发酵培养过程中对 微生物的生长和次代谢产物的合成进行控制, 同时通过在线监测 pH 值和溶氧值, 使发酵液 中残糖浓度维持在 0.8g/L-1.2g/L, 同时 pH 值维持在 7.5 以下, 溶氧维持在 40%-60%, 发酵 周期为 6-12 天 ; 6 - 脱羟基 -BLM S 在发酵液中的产量达 30mg/L 以上。 0016 在步骤 1) 发酵培养之前优选先对黄绿链霉菌 SB9026 进行涂布培养, 筛选高产菌 株 (所述高产菌株见实施例 4 中的菌种编号为 23 和 24 的菌种)。
25、 。 0017 步骤1) 优选为 : 将黄绿链霉菌SB9026菌株接种至种子培养基中培养, 在30下培 养 2 天 ; 再取所述种子培养基转接到发酵培养基中培养, 接种量为 10%(体积比) , 在 30 C 下培养 12 天 ; 所述种子培养基为 : 15g/L 甘油、 15g/L 棉籽粉、 3g/LNaCl 和 5g/L 蛋白胨, 其 余为水, pH 值为 7.0 ; 所述发酵培养基为 : 20g/L 葡萄糖, 15g/L 可溶性淀粉, 20g/L 黄豆粉, 5g/L 酵母粉, 0.1g/L CuSO45H2O, 0.5g/L ZnSO47H2O 和 3g/L CaCO3, 其余为水, p。
26、H 值为 7.0。 0018 步骤 2) 中所述逐级放大的方式具体优选为 : 先将 300l 黄绿链霉重组工程菌 SB9026 的孢子悬浮液接 (每 ml 悬浮液中有 106-107个孢子) 种到 60ml 种子培养基中进行第 说 明 书 CN 104004804 A 6 4/13 页 7 一级放大, 在32C下培养24小时后转至600ml发酵培养基中进行第二级放大, 并在32C 再次培养 24-36 小时直至菌丝体密度达到肉眼可见密集程度 ; 随后将所述 600ml 发酵培养 基转接至装有 6L 发酵培养基的 15L 发酵罐中进行发酵培养。 0019 步骤 2) 中发酵罐培养的具体方法优选为。
27、 : 当发酵罐的容积为 12L-20L 时, 发酵罐 开始培养时, 初始温度为 32 C ; 初始 pH 值为 6.8 ; 设置发酵罐溶氧值与转速为联动状态, 溶氧的下限值为30%, 转速范围为210rpm-400rpm ; 当发酵罐培养至20-26小时, 设置发酵罐 溶氧值与转速为联动状态, 将培养温度降低至30C ; 当发酵罐培养至55-65小时, 发 酵液 溶氧值跌至最低, 转速在最高值运转, 此时将培养温度进一步降低至 28 C ; 在发酵培养后 期约115-125小时, 发酵液溶氧值和pH值开始上升时, 开始补加葡萄糖溶液, 并实时测定发 酵液中残留的还原糖浓度, 通过调节补料的频率。
28、和速度以及葡萄糖溶液的浓度, 使发酵液 中残糖浓度维持在1g/L, 同时pH值维持在7.5以下, 溶氧在40%-60% ; 当发酵罐维持补充葡 萄糖 2-3 天, 溶氧和 pH 值开始进一步上升, 此时整个发酵周期结束。 0020 下面对本发明做进一步的解释和说明 : 0021 本发明所述的博来霉素族衍生物或其异构体、 非对映体、 对映体, 或其水解物、 水 合物、 金属螯合物, 或其医药用盐, 其化学结构通式如式 (I) 所示 : 0022 0023 其中, R1选自 H、 烷基、 氨基、 烃基、 酰基、 磺酰基、 卤代烷基、 杂烷基、 羟基烷基、 氨基 烷基或 -(CH2)n-C(NH2)。
29、=NH, 其中 n=1-6 ; 0024 R2选自 H 或 -OH ; 0025 所述烷基为 C1-C6 直链或支链脂族烃 ; 0026 所述杂烷基指 C1-C6 直链或支链脂族烃, 其中一个或者多个碳被 O、 S 或 N 取代 ; 0027 所述卤代烷基指 C1-C6 直链或支链脂族烃, 其中一个或者多个碳被 F、 Cl 或 Br 取 代。 0028 其中 R1优选为 -(CH2)n-C(NH2)=NH, n=1-4, 优选 n=2。 0029 当 R1为 -(CH2)2-C(NH2)=NH, R2为 -OH 时, 对于本发明中的一种具体的化合物, 化合 物 1, 其标准分子式 C53H79。
30、N19O21S2(C53H79N19O21S2+H+, 分子量为 1382.5212, 简称为 BLM S(天 赐 102) , 具体结构鉴定和活性测试参见实施例。 说 明 书 CN 104004804 A 7 5/13 页 8 0030 当 R1为 -(CH2)2-C(NH2)=NH, R2为 H 时, 对于本发明中的另一种具体的化合物, 化合 物 2, 其标准分子式 C53H79N19O20S2(C53H79N19O20S2+H+, 分子量为 1366.5263, 简称为 6 - 脱羟 基 -BLM S(天赐 103) , 具体结构鉴定和活性测试实施例。 0031 所述博来霉素族衍生物或其。
31、异构体、 非对映体、 对映体, 或其水解物、 水合物、 金属 螯合物, 或其医药用盐, 在 DNA 裂解活性方面的应用。 0032 所述博来霉素族衍生物或其异构体、 非对映体、 对映体, 或其水解物、 水合物、 金属 螯合物, 或其医药用盐, 在用于制备治疗抗肿瘤药物和抗生素类药物方面的应用。 0033 所述治疗抗肿瘤药物包括治疗鳞状上皮细胞癌, 包括皮肤癌、 头颈部癌、 食管癌、 肺癌、 宫颈癌、 阴道癌、 阴茎癌等, 以及恶性淋巴瘤、 脑瘤、 甲状腺癌、 生殖细胞瘤、 恶性黑色 素瘤、 神经胶质瘤、 霍奇金淋巴瘤、 睾丸癌、 前列腺癌、 肝癌、 胃癌、 肺癌、 结肠癌及消化道肿 瘤。 00。
32、34 所述博来霉素族衍生物或其异构体、 非对映体、 对映体, 或其水解物、 水合物、 金属 螯合物, 或其医药用盐, 在用于制备治疗白血病和银屑病药物方面的应用。 0035 本发明所述的一种用于制备博来霉素族衍生物的黄绿链霉菌 SB9026, 保藏 号 CCTCCM 2011292, 菌种名称为 : 黄绿链霉菌 SB9026. 拉丁文学名为 : streptomyces flavoviridis SB9026, 保藏编号为 : CCTCC NO:M2011292, 保藏日期为 : 2011 年 8 月 19 日, 保藏单位为 : 中国典型培养物保藏中心, 保藏单位地址 : 中国武汉, 武汉大学。
33、。 0036 所述黄绿链霉菌 SB9026 的制备方法是 : 从佐伯霉素的原始高产菌株黄绿链霉菌 SB9001 出发, 应用基因重组技术将黄绿链霉菌 SB9001 中的 zbmVIII 基因完全失活后得 到不生产佐伯霉素的黄绿链霉菌 SB9025 突变株 ; 同时以博莱霉素原始生产菌轮枝链霉菌 ATCC15003 为母体构建博莱霉素生物基因簇 blm 的人造细菌染色体 (BAC) 质粒文库, 从中筛 选出包含完整blm基因簇的BAC质粒pBS54 ; 最终以黄绿链霉菌SB9025突变株为异源宿主, 将 BAC 质粒 pBS54 转入其中获得黄绿链霉菌 SB9026。 0037 由于博莱霉素族抗。
34、癌抗生素的临床重要性, 为了开发高效低毒的新型抗癌药物, 研究人员进行了大量的研究来确定其分子结构与生物活性之间的关联。 一般认为博莱霉素 分子骨架中的双噻唑和 C- 末端的胺基部分对博莱霉素化合物与 DNA 之间的亲和作用起了 主导作用, 而且有可能影响着对 DNA 的辨识和 DNA 裂解的选择性 ; 而糖基团的功能尚未明 确, 很有可能参与了博莱霉素与细胞的辨识过程, 尤其是细胞的摄取和金属离子的配位等。 本发明涉及的 BLM S 是由博莱霉素的多肽分子骨架包括糖基团部分与佐伯霉素的 C- 末端 胺基链结合而成, 而6 -脱羟基-BLM S则是由博莱霉素的多肽分子骨架与佐伯霉素的C-末 端。
35、 胺基链和糖基团部分结合而成。根据 BLM S、 6 - 脱羟基 -BLM S 和 BLM A2的 DNA 裂解 活性测试比较, BLM S(EC50=320nM) 与 BLM A2(EC50=300nM) 的生物活性相当, 因此博莱霉 素与佐伯霉素的末端胺基基团互换以后并未明显影响其生物活性 ; 对于 6 - 脱羟基 -BLM S 和 BLM A2而言, 6 - 脱羟基 -BLM S(EC50=30nM) 强于 10 倍以上的 DNA 裂解活性则首次揭 示了糖基团在决定博莱霉素族化合物的生物活性中扮演了重要的角色。 0038 博莱霉素有独特的分子结构和生物活性, 能够介导激活氧分子, 并选择。
36、性地引起 单链和双链DNA的断裂从而抑制肿瘤细胞DNA合成和复制。 此外, 博莱霉素还可以选择性地 裂解 RNA 从而抑制蛋白质的合成。因此博莱霉素族化合物的 DNA 裂解活性的强弱直接反映 了其抗癌活性的高低。6 - 脱羟基 -BLM S 极强的 DNA 裂解活性也预示其更好的抗癌活性, 说 明 书 CN 104004804 A 8 6/13 页 9 因此可以减少其临床用量并极大地降低其剂量依赖性肺毒性, 从而克服了当前博莱霉素临 床治疗应用的一大挑战。 0039 与现有技术相比, 本发明的优势在于 : 0040 1、 本发明提供了一系列优化改良的发酵培养基, 可以提高新型活性博莱霉素衍生 。
37、物 6 - 脱羟基 -BLM S 通过微生物发酵制备时的产量。 0041 2、 本发明提供了一套微生物发酵制备工艺, 可以缩短新型活性博莱霉素衍生物 6 - 脱羟基 -BLM S 的微生物发酵制备周期, 并进一步提高其产量 ; 同时 6 - 脱羟基 -BLM S 在总产物中所占的比例明显提高, 有利于下游的分离提取和产物富集。 0042 3、 本发明中提供的新型活性博莱霉素衍生物 6 - 脱羟基 -BLM S 的微生物发酵制 备方法不仅简化了培养基成分, 降低了生产成本, 为将来新型活性博莱霉素衍生物 6 - 脱 羟基 -BLM S 的中试规模生产和工业化应用奠定了坚实的基础。 附图说明 00。
38、43 图 1 是通过 pBluescript II SK(+) 质粒松弛活性分析来测试 BLM S(化合物 1) 和 6 - 脱羟基 -BLM S(化合物 2) 的 DNA 裂解活性, 并与 BLMA2进行比较 ; 0044 其中, 图 1(a) 是固定浓度下的终点分析比较化合物 1、 化合物 2 和博来霉素 A2的 DNA 裂解活性 ; 图 1(b) 以 6 - 脱羟基 -BLM S(化合物 2) 诱导的 DNA 裂解为例通过动力学 分析确定 EC50值 ; 其中 A 代表超螺旋质粒 DNA ; B 代表开环质粒 DNA ; C 代表线形质粒 DNA。 0045 另外, 本发明的保藏号 CC。
39、TCC M 2011292 的菌种保藏信息如下 : 0046 菌种名称为 : 黄绿链霉菌 SB9026. 0047 拉丁文学名为 : streptomyces flavoviridis SB9026, 0048 保藏编号为 : CCTCC NO:M 2011292, 0049 保藏日期为 : 2011 年 8 月 19 日, 0050 保藏单位为 : 中国典型培养物保藏中心, 0051 保藏单位地址 : 中国武汉, 武汉大学。 具体实施方式 0052 下面结合实施例进一步解释和说明本发明, 以下所有百分含量均指质量百分含 量。 0053 实施例 1 : 0054 黄绿链霉菌SB9001和实验中。
40、得到的基因工程突变菌株均在30C的ISP4琼脂固 体培养基上培养以获取孢子。轮枝链霉菌 ATCC15003 在含有 0.5% 甘氨酸的 TSBY 液体培养 基中, 28C和250rpm转速下生长以获取基因组DNA。 大肠杆菌在LB液体培养基中, 37C 和 250rpm 转速下生长用于日常的质粒克隆, BAC 文库的建立。 0055 1) 黄绿链霉菌 SB9025 突变株的构建 0056 从包含一部分佐伯霉素生物合成基因簇 zbm 的科斯质粒中分离得到了大小为 10kb 的含有完整的 zbmVIII 基因的 DNA 片段, 并通过 BamHI 和 BglII 酶切位点将该 10kb DNA 片。
41、段克隆到 Litmus 28 质粒上。所得质粒经 Sbf1 酶切后将约 3.7kb 大小的插入片段移 除, 然后质粒再进行自我连接, 完成 zbmVIII 基因的敲除。将这一更改过的 DNA 插入片段经 说 明 书 CN 104004804 A 9 7/13 页 10 过BamHI和BglII酶切后释放, 并转移连接至pOJ260质粒中, 所得质粒转入大肠杆菌S17-1 中作为配体菌株与黄绿链霉菌SB9001进行接合转移实验。 通过PCR实验对接合体进行筛选 后分离得到双交换重组的黄绿链霉菌 SB9025 突变株, 并最终通过 DNA 印迹实验对 zbmVIII 基因的敲除进行验证。 0057。
42、 2) 轮枝链霉菌 ATCC15003 基因组 BAC 文库的建立和筛选 0058 基因组 BAC 文库的构建按照标准试验操作进行。对插入 DNA 片段的平均大小进行 检查后, 从平板上挑选的 BAC 克隆被转入冷冻的 96 孔板上并在 -80 C 冷藏过夜。随后这 些克隆被转移到 Hybond-N+ 膜 (Amersham Pharmacia, 美国 ) 上通过杂交进行固定, 并与 BlmA 探针进行杂交实验。BlmA 探针由引物 BlmAF(5-CATATGGTGAAATTCTTGGGTGCCG-3) 和 BlmAR(5-AAGCCTCTCCCCCGCGGTGAAGTG-3) 扩增得到。最。
43、后通过 ORF32 引物 C-PHNA-F1(5 -GCAGCGTCATGAACAGGGTG-3) 和 C-PHNA-r1(5-CCGGACCATCATGTAGCGAC-3 ) 对杂交所得 的阳性克隆进行 PCR 筛选, PCR 扩增程序为 : 94 C 2 分钟 ; 94 C 30 秒 ,55 C 30 秒, 72 C 1 分钟共 35 个循环 ;72 C 7 分钟。最终筛选出包含完整 blm 基因簇的 BAC 质粒 pBS54。 0059 上 述 基 因 序 列 号 码 均 在 美 国 的 Genebank(http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/ genbank/) 上公开。
44、发布, zbmVIII 基因 (Genbank accession number : EU670723) , blm 基因 簇, 以及 BlmA 探针和 ORF32(Genbank accession number : AF149091, AF210249) 。 0060 3) 黄绿链霉菌 SB9026 的构建和发酵培养 0061 将BAC质粒pBS54转入黄绿链霉菌SB9025突变株中得到黄绿链霉菌SB9026, 并通 过 PCR 实验和 DNA 印迹实验对 blm 基因簇的转入进行验证。将黄绿链霉菌 SB9026 的孢子 悬浮液接种至 50ml 种子培养基 (15g/L 甘油, 15g/L。
45、 药用培养基药媒, 3g/L NaCl, 2g/L 天冬 酰胺酸, pH 值用 1N 盐酸调至 7.0) 中生长。在 30 C 和 250rpm 转速下培养 2 天后, 50ml 种 子培养基被转接到 500ml 发酵培养基 (6.4g/L 粟米果冻, 5g/L 葡萄糖, 35g/L 黄豆粉, 7.5g/ L 玉米浆, 2g/L NaNO3, 3g/LNaCl, 1g/L K2HPO4, 0.1g/L CuSO45H2O, 0.5g/L ZnSO47H2O, pH 值用 1N 盐酸调至 7.0) 中, 在 30 C 和 250rpm 转速下发酵 12 天。 0062 实施例 2 : 0063 。
46、新型博莱霉素类似物 BLM S(天赐 102, 化合物 1) 和 6 - 脱羟基 -BLM S(天赐 103, 化合物 2) 的分离提纯和检测 0064 将发酵液离心后所得的上清溶液进行高效液相 (HPLC)检测分析, 流动相 A 为 99.9% 去离子水和 0.1% 醋酸, 流动相 B 为 99.9% 甲醇和 0.1% 醋酸, 流速为 0.8mL/min, 紫外 检测器波长为 300nm。线性梯度分析程序为 : 0-30 分钟, 100%A/0%B 至 0%A/100%B。其余上 清液用 1N 盐酸调至 pH 7.0 后载入 Amberlite IRC50(NH4+type) 树脂柱, 经 。
47、10 倍柱体积去 离子水冲洗后, 用 2 升 20% 醋酸铵溶液进行洗提。得到的洗提液与 Diaion HP-20 树脂混合 并在室温下温和震荡 45 分钟进行吸附, 然后将 HP-20 树脂装填入柱用 10 倍柱体积去离子 水冲洗并排干残余水, 用 5 倍柱体积的甲醇进行洗提, 收集的甲醇洗提液进行浓缩后得到 粗提物。将粗提物再次载入 Sephadex LH-20 柱并用甲醇进行洗提, 含有化合物 1 和 2 的组 分被分别合并蒸干, 最后通过半制备高效液相进行提纯。制备柱首先用 100%A 进行平衡, 然 后用线性梯度程序 (0-20分钟, 100%A/0% B至36%A/64% B) 进。
48、行洗脱, 流量为3mL/min, 紫外 探测波长为 300nm。化合物 1 在 11.1 分钟被洗脱, 化合物 2 在 11.4 分钟被洗脱, 所得的洗 说 明 书 CN 104004804 A 10 8/13 页 11 脱液冻干蒸发后得到纯的浅蓝色铜离子复合物1和2。 将铜离子复合物用0.5M EDTA-Na(pH 7.0) 溶液处理后得到不含铜离子的纯化产物, 白色粉末状化合 物 1 和化合物 2。 0065 BLM S(天赐 102, 化合物 1) 和 6 - 脱羟基 -BLM S(天赐 103, 化合物 2) 的结构分 析说明 : 0066 两种新型博莱霉素类似物通过全面的光谱分析进行。
49、了完整的结构表征。紫外光 谱分析 (最大波长分别为 200、 248 和 294nm) 证明了化合物 1 和 2 含有博莱霉素族化合物 中特有的双噻唑发光基团。高分辨基质辅助激光解吸电离质谱 (MALDI-MS) 分析得到化合 物 1 的 M+H+分子离子峰 (m/z) 为 1382.5274, 与其标准分子式 C53H79N19O21S2(C53H79N19O21 S2+H+, 分子量为 1382.5212) 的数值一致。1H 与 13C 核磁共振谱 (NMR) , 以及二维 NMR 的联 合分析表明化合物 1 中含有博莱霉素的特征结构部分, 包括金属离子结合功能域 (嘧啶并 blamic 酸 (PBA) 子单元以及临近的羟基化组氨酸) 、 (2S,3S,4R)-4-。