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采用器官外部解剖特征的器官图像的配准。一种成像方法,包括接收受检者体内器官附近的第一个三维(3D)图像和创建器官附近第一个3D图像中的管状结构的几何模型。将侵入性探针插入器官,并使用侵入性探针捕获包含器官的第二个3D图像。使用侵入性探针在管状结构的表面上定位一个或多个点,以及通过将一个或多个点与几何模型匹配来配准第二个3D图像与第一个3D图像。。