作为融合蛋白的异源抗原的表达系统 【技术领域】
本发明涉及生物技术和遗传工程领域，更具体地说，本发明涉及使用重组DNA技术经与细菌肽融合在微生物宿主中表达异源蛋白质的方法。现有技术
用重组DNA技术在大肠杆菌中产生任何来源的蛋白质的有效性已有广泛说明。为此，尽管由于克隆和表达的各种基因通常需要单个对待，需要新的变体，但已开发了大量载体(Denhardt，D.T.和Colasanti，载体杂志，Butterworths，Stoneham，M，pp.179，1987和Lukacsovich，T.等，生物技术杂志，13，243，1990)。
由于可以获得高的表达水平，胞内合成已用于在大肠杆菌中获得异源多肽(Goeddel，D.V，酶学方法，185，3-7，1990)。然而，对宿主蛋白酶的敏感性和表达的蛋白质的毒性之类的因素可以明显降低所说的水平，而不依赖于高效调节序列的使用(Reads，C.A.和Saier，M.H.，细菌学杂志，153，685-692；Gwyn，G.W.，膜蛋白表达系统：用户指南，波特兰出版社，伦敦，英国，29-82)。
在合适的载体中，与编码宿主细胞中稳定多肽地核酸序列同读框克隆编码兴趣蛋白质的核苷酸序列，导致在细胞质中表达被称为融合蛋白的杂合产物(Marston，F.A.O.，生物化学杂志240，11986)。这种多肽一般对宿主的蛋白酶解降解较不敏感，或者由于形成包含体毒性较低。这导致比不使用稳定子肽时所获多肽较高的表达水平(Itakura，K.等，科学，198，1056，1977)。此外，如果可以使用不同的用于重组产物随后复性的方法，这类表达会有利于简化初始纯化步骤(Fischer，B.，Sumner，I.和Goodenough，P.，生物技术和生物工程，41，3-13)。
在大肠杆菌中许多重组蛋白质的表达期间，包含体是不溶性蛋白质聚集体，在胞质溶胶中表现为电子致密体(Rinas，Or.和Bailey，应用微生物学和生物技术杂志，37，609-614)。它们是部分折叠的多肽之间相互作用的结果，由于其中疏水残基对溶剂的暴露，其聚集体是热力学上有利的(Kiefhaber，T.，Rudolph，R.等，生物技术，9，825-829)。由于含丰富的二硫键-形成氨基酸(半胱氨酸)或β转角-形成氨基酸(脯氨酸)，许多真核蛋白质在细菌胞质溶胶中的缓慢折叠使得它们作为稳定化肽广泛使用。为这一目的，前者的例子使用具有抗体结合活性的多肽，它们来源于人奶脂肪球蛋白(HMFG)(按照国际专利申请PCT No.WO 9207939 A2 920514)；免疫球蛋白恒定区(如欧洲专利申请No.EP 0464533 A1 920108中描述的)；人血管生成素(欧洲专利申请No.EP 0423641 A2 910424)、生长激素(EP0429586 A1 910605)，谷胱甘肽-S-转移酶(WO 8809372 A1 881201)和猪腺苷酸激酶(EP 0423641 A2 910424和EP 0412526 A2 910213)。
然而，如果融合蛋白是疫苗候选者，则使用构成融合蛋白显著部分的稳定子多肽具有某些缺点，因为外源序列的存在可以改变B和T细胞表位的天然顺序(Denton G.，Hudecz，F.，Kajtar，J.等，肽研究，7，258-264)或者它们被抗原呈递细胞的加工(Del Val，M.，Schlicht，H.，Ruppert，T.，等，细胞，66，1145-1153)，甚至经特异表位抑制现象严重影响候选者的免疫原性(Etlinger，H.，现代免疫学，13，52-55)。
由于以上提及的现象，一些研究组试图确定仍然使表达稳定化的小片段。例如，德国专利申请3541856 A1(Hoechst AG)报道了使用稳定子肽以获得在大肠杆菌中合成的可溶形式的融合蛋白的可能性，所述肽由人类蛋白质白介素(IL-2)N-末端头95个氨基酸构成。类似地，在同一公司的欧洲专利申请0416 673 A2和229 998中，使用了与所说蛋白质的头58个或38个氨基酸一致的稳定子肽。在欧洲专利416 673 B1中，也使用了IL-2的头58个氨基酸，为了这一目的，在使用人血清白蛋白N-末端片段(欧洲专利申请EP 0423641 A1 920212)、结缔组织的激活剂肽III(WO 90136647 A1901115)、人类激肽释放酶片段(EP 0381433 A1900808)的情况下，采用了类似的策略。这些发明给出了以前的问题的解决办法，但是所获得的融合多肽不能包含到用于人类的疫苗制剂中，因为其中存在与人类蛋白质同源的或相同的序列，有诱导自身免疫疾病的可能性。
也已成功地开发了供胞内表达的使用细菌来源(并且由此没有与人源抗原的交叉反应性)的稳定子多肽的替代方案。一种对这一目的最有用的蛋白质是大肠杆菌β-半乳糖苷酶(Itakura，K.等，科学，198，1056 1977)或其部分(Hoechst AG公司的德国专利申请EP 0235754 A2 870909)。这个系统的主要缺点是这种蛋白质大，这使得所需肽仅代表总杂合蛋白的一小部分(Flowers，N.等，应用微生物学和生物技术25，267 1986；G oeddel，D.V.等，P.N.A.S.USA,76,106)。类似问题出现在破伤风类毒素C片段和假单胞菌外毒素的应用中(国际专利申请PCT WO 9403615 A1 940217和欧洲专利申请EP 0369316 A2 900523)。非常合适的表达变体是使用具有大肠杆菌tiorredoxin的融合物(PCT专利申请WO 9402502 A1 940203)，为了有利于纯化，其利用了经渗透压从细胞释放的性质(Elyaagoubi，A.，Kohiyama，M.，Richarme，G.，细菌学杂志，176，7074-7078)。然而，这一方式对包含体的获得是不成功的，因为通过这一步骤，包含体不能被游离出来。
许多这样的问题已由模拟融合蛋白的设计解决。在这些设计中，稳定子肽与兴趣蛋白质靠允许两者独立折叠的间隔分离开，其氨基酸序列使其对特异性内肽酶的进攻敏感。如果有识别所选稳定子的配体，则经亲和色谱法纯化融合多肽和经用不同的蛋白酶处理从稳定子最终分离它是可能的(Cress，D.，Shultz，J.和Breitlow，S.，Promega you Note，42，2-7)。另一个优点是在接下来的纯化的中间步骤中利用这一分子相互作用，而不需要每种所表达蛋白质的抗体。这一点的一个众所周知的实例是利用组氨酸(His)与系统中某些金属(如镍(Ni)和锌(Zn))的亲和性，按照Upjoho公司的PCT专利申请WO 9115589 A1 911017中的描述，所述系统由具有6个串联His的稳定子和镍螯合物亲和基质组成。尽管如此，这一种类的表达系统不是在所有情况下都起作用，因为除了其它原因外，兴趣蛋白质可以具有所选蛋白酶的限制性位点，或折叠后有暴露于溶剂的间隔(Uhlen，M.和Moks，T.，酶学方法.185，129-140；Cress，D.，Shultz，J.和Breitlow，S.，Promega youNote，42，2-7)，以致干扰稳定子和亲和基质之间的结合(新英格兰生物实验室，The NEB Transcript，3，14)，或者只是其纯化需要影响它的生物活性的条件。由于这些理由，需要不同的变体，因为各种要表达的蛋白质代表特定的情形。为了这一目的，已经开发出基于下列蛋白质的稳定子肽：大肠杆菌麦芽糖结合蛋白(MalE)，其对直链淀粉树脂具有亲和性(欧洲专利申请EP 0426787 A1 910515)；氯霉素乙酰转移酶(欧洲专利申请EP0131363 A1 850116)或谷脱甘肽-S-转移酶(Amrad公司的欧洲专利申请EP 0293249 A1 88130)，其可用固定化底物获得；金黄色葡萄球菌蛋白质A(按照专利申请PCT WO 9109946 A1 910711)；或薛曼纳氏丙酸杆菌转羧基酶复合物的12.5kDa亚单位，其在体内生物素化，并使得可以进行基于抗生物素蛋白的生物素亲和性的纯化(Cress，D.，Shultz，J.和Breitlow，S.，Promega Notes，42，2-7，专利申请EP 0472658 A1 920304或WO 9014431A1 901129)。
欧洲专利申请EP 0472658 A1 920304或WO 9014431 A1 901129中描述的方法具有特别意义，该方法是由生物技术研究与发展公司与美国伊利诺州大学一同开发的。在这一申请中，描述了一种表达系统，其使用二氢硫辛酰胺乙酰转移酶硫辛酸结合域(EC 2.3.1.12)，也被称为大肠杆菌丙酮酸脱氢酶复合物E2亚单位。这一结构域通过添加硫辛酸分子到一个赖氨酸的氮原子上被体内翻译后修饰(Guest，J.R.，Angler，J.S.和Russell，G.C.，Ann.N.Y.Acad.Sci.，573，76-99)，其被用来纯化和鉴别融合蛋白，其中使用仅识别硫辛酸化结构域的抗体。
然而，这一方法具有许多弊端。首先，已知包含硫辛酸结合结构域的蛋白质的超量表达会超过细胞硫辛酸化容量，结果产生非硫辛酸化结构域(Thousands，J.S.和Guest，J.R.，生物化学杂志，245，869-874；All，S.T.和Guest，J.R.，生物化学杂志，271，139-145)或辛酸化结构域(Ali，S.T.，Moir，A.J.，Ashton，P.R.等，分子微生物，4，943-950；Dardel，F.，Packman，L.C.和Perham，R.N.，FEBS Lett.295，13-16)，这可以导致免疫亲和纯化降低产量。在第二方面，有一组推定由自身免疫引起的疾病，其共同特征是存在在这些结构域中特异性识别硫辛酸的抗体。它们主要是早期胆汁性肝硬变，以发炎和肝内胆汁导管进行性阻碍为特征的一种慢性病(Tuaillon，N.，Andre，C.，Briand，J.P.等，免疫学杂志，148，445-450)；和由卤烷(一种通过形成三氟乙酰赖氨酸衍生某些蛋白质的广泛使用的麻醉剂)引起的肝炎(Gut，J.，Christen，Or.，Frey，N.等，毒理学，97，199-224)。患这种疾病的患者的血清识别所说复合物，其分子结构与二氢硫辛酰胺乙酰转移酶中的硫辛酸相似(Gut，J.，Christen，Or.，Frey，N.等，毒理学，97，199-224)。鉴于这一理由，如果包含硫辛酸的融合蛋白构成用于人的疫苗候选者，则最好避免在这样的肽中存在硫辛酸。发明描述
本发明的目的是提供一种在大肠杆菌中高水平地表达作为融合多肽的异源蛋白质的方法，其基于使用来源于脑膜炎奈瑟氏球菌(Neisseriameningitidis)B：4：P1.15(欧洲专利申请0474 313 A2)的P64K抗原头47个氨基酸的稳定子序列，所说稳定子赋予它们被作为包含体表达的能力。尽管存在与部分二氢硫辛酰胺乙酰转移酶硫辛酸结合域的同源性，所说的序列已经由基因工程操作消除了自身修饰的可能性，并且具有低免疫原性的优点。这一方法也包括使用特异性地识别被论及的稳定子的单克隆抗体，使得可以进行任何融合到所述稳定子上的蛋白质的免疫检测。
更具体地说，在本发明中，使用了作为表达载体的重组质粒，该质粒携带在大肠杆菌色氨酸启动子(ptrip)控制下的所述序列，其后是限制性位点XbaI，EcoRV和BamHI。这些使得可以在同读框中克隆编码兴趣多肽的DNA片段。这一载体也包含噬菌体T4基因32的转录终止子和作为选择性标记的氨苄青霉素抗性基因。
这一方法也使得在用于人类的疫苗制剂中包含所获得的融合多肽成为可能；并且所采用的稳定子肽的性质使得可以产生针对与其结合的外源蛋白质或多表位肽的保护性免疫反应。
基因工程操作和使用与部分二氢硫辛酰胺乙酰转移酶硫辛酸结合结构域的同源稳定子肽，以便经重组DNA技术在大肠杆菌中产生融合蛋白构成了本发明的新颖性。更具体地说，为了前述的目的，使用来源于脑膜炎奈瑟氏球菌B：4：P1.15的P64K抗原头47个氨基酸的稳定子肽以及特异性识别所述稳定子的单克隆抗体构成了本发明的新颖性。
实施例：实施例1：
脑膜炎奈瑟氏球菌LpdA抗原(P64K LpdA)是594个氨基酸的蛋白质，属于二氢硫辛酰胺脱氢酶(EC 1.8.1.4)家族，更具体地说，属于其中的一个新亚组，以在其N-末端部分具有硫辛酸结合结构域(其类似于存在于二氢硫辛酰胺乙酰转移酶中的结构域)为特征(Kruger，N.，Oppermann，F.B.，Lorenzl，H.和Steinbchel，A.，细菌学杂志，176，3614-3630，1994；Hein，S.和Steinbchel，A.，细菌学杂志，176，4394-4408，1994)。LpdA蛋白质已在大肠杆菌中克隆和超量表达，在其N-末端具有5个附加的氨基酸(MLDKR)(欧洲专利申请0474 313 A2；图1)，尽管名称LpdA和P64K是等价的，但将利用P64K指重组蛋白质。
为了确定所说抗原的不同片段的免疫原性和分析利用较低免疫原性稳定子肽的可能性，通过评价多克隆抗-P64K血清对合成肽的反应性定位存在于P64K中的B细胞表位。
为了这一目的，经在丁基-TSK中的疏水性色谱和凝胶-过滤纯化P64K蛋白质(欧洲专利申请0 474 313 A2)；经三氯乙酸(TCA)沉淀变性，用NaOH中和，并且经凝胶-过滤色谱在磷酸盐缓冲液中平衡。将这一制剂经皮下路线以20μg剂量辅以2μg氢氧化铝(0天)免疫30只小鼠Balb/C，7和21天后，用相同的抗原加强免疫。在第一次抽取之后28天收集血清。合并所获得的血清，将形成的混合物等分并贮存在-20℃下。
此外，按照制造者提供的说明，以96孔平板方式使用用于固相合成的市售试剂盒(Multipin肽合成系统，Chairon Mimotope Pty.有限公司，美国)合成了具有20个氨基酸(a.a.)的59种肽(各覆盖完整的重组蛋白质序列并有10个a.a.重叠)。随后，将这些从蛋白质的N-末端编号。采用1∶2000相同的稀度测定血清抗P64K针对这些肽的反应性，使用的免疫测定的方式与由前述市售试剂盒的制造者推荐的相同。
结果在图2中显示，其中给出了每种肽的吸光值。很明显，头110个氨基酸(由肽1到肽11代表)形成差的致免疫区段(尽管免疫原变性，其甚至能够暴露隐藏的表位)。这一区段基本上包括硫辛酸结合结构域和富含脯氨酸和丙氨酸的间隔(其将所述结构域连接到蛋白质的其余部分上)。这一结果说明，所述的稳定子肽(或者其衍生物片段)可以有效地用作稳定子肽，这是由于对与其融合的多肽的免疫原性影响小。如果融合多肽构成疫苗候选者，这一优点尤其重要。实施例2：
为了在大肠杆菌中通过将不同的异源蛋白质融合进脑膜炎奈瑟氏球菌B：4：P1.15的P64K抗原的硫辛酸结合结构域来表达异源蛋白质，构建表达载体pM-83，其中引入了编码来源于所说蛋白质的头47个氨基酸的稳定子肽的序列(序列识别号：1)。在大肠杆菌色氨酸启动子的控制下克隆该序列，引入的序列包括作为转录终止信号的噬菌体T4终止子和作为选择性标记的氨苄青霉素抗性基因。
为了获得pM-83表达载体，首先从质粒pM-6经聚合酶链反应(PCR)(Randall，K-等，科学，42394，487-491，1988)扩增稳定子肽，所述质粒携带编码P64K抗原的核苷酸序列(欧洲专利申请0 474 313 A2，图1)。为了这一目的，使用寡核苷酸引物1573和1575，其在扩增的DNA片段中引入相应于所述DNA编码的稳定子的氨基和羧基末端的NcoI和XbaI限制性位点：NcoI1573：5’TTCCATGGTAGATAAAAG 3’(序列识别号：2)XbaI1575：5’TTTCTAGATCCAAAGTAA 3’(序列识别号：3)
由形成的稳定子编码的氨基酸序列示于图3中(序列识别号：6)。NcoI限制性位点的引入使亮氨酸2改变成缬氨酸；引物1517消除序列ETD(45-47位)，在它的位置上引入序列DLE。以这种方式，硫辛酸的结合赖氨酸(48位)不形成稳定子的一部分。其邻近区(在这些结构域中其是高度保守的(Russell；G.C.，Guest，J.R.，生物化学和生物物理报告，1076，225-232，1991))被改变。所有这一切保证消除含有这些结构域的融合蛋白的翻译后被硫辛酸化的可能性，以及在用这些蛋白质免疫期间产生与存在于早期胆汁性肝硬变患者中的那些有类似特异性的自身抗体(Tuaillon，N.，Andre，C.，Briand，J.P.等，免疫学杂志，148，445-450)的可能性。
通过克隆这一片段(序列识别号：5)于质粒pILM-29(Guillén，G.，Loyal，M.，Alvarez，A.等，生物技术学报，15，97-106，1995)中构建质粒pM-83，所述片段已用XbaI/NcoI事先消化。pILM29质粒包含与人IL-2头58个氨基酸一致的稳定子肽融合的脑膜炎奈瑟氏球菌Opc(5c)基因，因而这种克隆过程是除去IL-2片段并使Opc融合到P64K蛋白质稳定子上(图4)。用酶XbaI和BamHI从形成的质粒(命名为pM-80)切除Opc基因，在其位置上克隆由寡核苷酸1576和1577杂交形成的接头，这一过程在稳定子片段的3’末端引入限制性位点XbaI，EcoRV和BamHI：1576 5′CTAGATTTGATATCAG 3′(序列识别号：7)1577 3′TAAACTATAGTCCTAG 5′(序列识别号：8)
这一质粒命名为pM-83(图4)。按照Sanger，F.等(PNAS，USA，74：54631977)的方法经DNA测序证实了所有DNA片段和寡核苷酸的插入以及正确读框的保持。实施例3：
如果形成的融合蛋白是疫苗候选者，重要的是所说稳定子不含有与人类蛋白质高度同源的区。通过在核苷酸序列数据库EMBL数据库v.38(Curl，C.M.，Fuchs，R.，Higgins，D.G.等，Nucl.Acids Beast.21，2967-2971，1993)和氨基酸序列的SWISS-PROT数据库v.38(Bairoch，A.和Boeckmann，B.，Nucl.Acids Beast.21，3093-3096，1993)中的同源性检索进行了pM-83稳定子肽(实施例2)与人类蛋白质的类似性研究。使用的均是1994年3月版本的两个BLAST程序(Altschul，S.F.，Gish，W.，Miller，W.，Myers，And.W.和Lipman，D.J.，分子生物学杂志，215：403-410，1990)：BLASTP，其将一个氨基酸序列与蛋白质序列库(base)比较(在这种情况下是SWISS-PROT)；和TBLASTN，其将氨基酸序列与所有两个方向上的所有核苷酸序列库中读框中的翻译产物比较(在这种情况下是EMBL数据库)；在两种情况下均使用了辅助基质PAM 120[Dayhoff，M.O.，Schwartz，R.M.和Orcutt，B.B.，in：Dayhoff，M.Or.(of.)，蛋白质序列和结构图谱，5，增补本3，345-352，Natn.Biomed.Beast.Found.，华盛顿，1978]。
可以从图6和图5看出结果，其中显示了BLASTP和TBLASTN各自的结果单(为了更好地理解，省去了原核生物或低等真核生物的同源序列。很明显，没有人类蛋白质或来源于其它哺乳动物的蛋白质表现出与P64K来源的稳定子的明显的类似性；因为由两种算法检测的同源性(在人和大鼠丙酮酸激酶中；和人和犬粘蛋白的C-末端中)存在最高的偶然出现的可能性(在维涅兰德固氮菌二氢硫辛酰胺乙酰转移酶的情况下作为比较点的相同的可能性是3.7×10-5)。
从所有以上所述可以得出结论，在疫苗候选者中使用所说的稳定子是绝对有把握的。实施例4：
通过比较融合到人白介素-2(IL-2)头22个或58个氨基酸的几种蛋白质(一种常用于该目的的融合肽)或按照实施例2所述修饰的融合到P64K抗原头47个氨基酸上的几种蛋白质的表达，评价了pM-83中的稳定子允许高水平和以包含体形式胞内合成的能力。
为了这一目的，将编码脑膜炎奈瑟氏球菌B：4：P1.15 PorA和Opc外膜蛋白的基因克隆进载体pFP15(hIL2-58；欧洲专利416 673 B1)或pM-83(P64K-47)；并将编码多表位肽(MEP)(包含人类免疫缺损病毒几种分离物的致免疫区)的基因克隆进载体pISL31(hIL2-22，Castellanos-Sierra，L.R.，Hardy，E.，Ubieta，R.，等，提交的论文)或pM-83。所形成的表达质粒是：pILM-28(IL2-58 PorA；Guillén，G.，Alvarez，A.，Lion，L.，等，494-498 in：Conde-González，C.J.，Morse，S.，Rice，P.等(编者).，奈瑟氏球菌科的病理学和免疫学，Institute de Salud Pública Nacional，Cuernavaca，Mexico，1994)，pM-82(P64K-47 PorA；Niebla，O.，Alvarez，A.，González，S.等，85-86 in：Evans，J.S.，Yost，S.和Maiden，M.C.J.等(编者)，奈瑟氏球菌属94：第IX次国际致病奈瑟氏球菌属会议论文集，Winchester，英国，1994)，pILM-29(IL2-58 Opc；Guillén，G.，Leal，M.，Alvarez，A.等，生物技术学报，15，97-106，1995)，pM-80(实施例2，图4)，pTAB4(IL2-22+MEP)和pTAB9(P64K-47 MEP)。
TAB4和TAB9蛋白质是多表位多肽(MEP)，其包括HIV-1gp120蛋白质可变区3(V3)中心部分的几个拷贝。为了构建这些MEP，选择了下列分离物的V3区的15个中心氨基酸：LR150：SRGIRIGPGRAILAT(序列识别号：9)JY1：RQSTPIGLGQALYTT(序列识别号：10)RF：RKSITKGPGRVIYAT(序列识别号：11)MN：RKRIHIGPGRAFYTT(序列识别号：12)BRVA：RKRITMGPGRVYYTT(序列识别号：13)IIIB：SIRIQRGPGRAFVTI(序列识别号：14)
这些区由序列为AGGGA(序列识别号：17)的五个氨基酸的间隔肽结合。
为了达到这一目的，用化学合成获得编码由间隔肽结合的V3表位的DNA序列(序列识别号：21)，并且在色氨酸启动子控制下克隆，融合进人IL-2的头22个氨基酸(图7)。通过用酶ScaI和HindIII消化从形成的质粒(命名为pTAB3)切除包含MEP基因、色氨酸启动子以及T4终止子的片段，并克隆进pUC19(Yanisch-Perron，C.等，1985，基因33，103-119)以获得pTAB4(图7)。最后，构建pTAB9，通过用酶NcoI和XbaI消化消除编码来源于人IL-2的稳定子序列，在它们的位置上克隆由聚合酶链反应(PCR)获得的编码P64K抗原的头47个氨基酸的片段(如实施例2所述)。形成的序列如图8所示，其组成如图9所示。
用于所有这些质粒的宿主大肠杆菌是W3110(Hill，C.W.，和Hamish，B，W.美国科学院学报，78，7069，1981；Jensen，K.F.，细菌学杂志，175，3401-3407，1993)(用于pILM-28，pILM-29，pM-80和pM-82)；和W3110trpA905(用于pTAB4或pTAB9)。所有这些均获得了表达：将培养物接种到5ml具有氨苄青霉素(Ap)50μg/ml和色氨酸(W)100μg/ml的LB培养基(Sambrook，J.，Fritsch，Y.F.和Maniatis，T.，分子克隆：实验室手册，冷泉港实验室出版社，1989，纽约，美国)上。于37℃生长12小时。用所述培养物接种50ml LB-Ap培养基(pTAB4和pTAB9)或由以下物质组成的限定培养基：M9盐(Miller，J.H.，分子遗传学实验，冷泉港实验室出版社，1972，纽约，美国)，葡萄糖1％，酪蛋白水解产物1％，CaCl2 0.1mM，MgCl2 1mM和Ap 50ug/mL(plLM-28，pILM-29，pM-80，pM-82)，于37℃和250r.p.m下生长12小时。此后，取得总蛋白样品，经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE，Laemmli，O.K.，自然，277，680，1970s)和用考马斯亮蓝R-250染色分析。在激光Bromma-LKB密度计中分析表达百分比。通过用溶菌酶和超声波结合处理裂解细胞确定它们的细胞定位。然后经离心将不溶性蛋白质和可溶性蛋白质分离。不溶性蛋白质用作估价其作为包含体的表达水平，因为在这种情况下，它们能表现出所说行为(与膜或肽聚糖结合)的其它条件是靠不住的。
总的结果可以从图10A中看出。在所有情况下，在来源于P64K的稳定子下的表达与在融合进IL-2肽时获得的表达是可比较的：这是就异源蛋白质/总细胞蛋白质之比而言(参见有关MEP的图10B)，其证实了pM-83用作表达融合肽的载体的能力。值得注意的是如果它们不是融合的，则这些多肽难于在大肠杆菌中表达，这是因为它们的小的尺寸和对宿主蛋白酶的敏感性(如MEP)或者蛋白质PorA和一般细菌porins的毒性(Carbonetti，N.H.和Sparling，P.F.；美国科学院学报U.S.A.，84，9084-9088)。在所有的情况下，所述产物以包含体获得，如由pTAB9所例证的(图10C)。
总之，得出以下结论是可能的，与其它系统(欧洲专利申请0 416 673 A2和229 998，Hoechst AG；欧洲专利申请0 416 673 B1；Castellanos-Sierra，L.R.，Hardy，E.，Ubieta，R.，等，提交的原稿)比较，使用来源于脑膜炎奈瑟氏球菌P64K抗原头47个氨基酸的稳定子(P64K-47)导致有效地以包含体表达异源蛋白质，并且由于不存在与人源抗原明显的同源性，具有产物可直接使用的额外的优点。实施例5：
特异性识别稳定子之配体(例如抗体，酶促辅因子等)的可获得性是任何重组蛋白质的表达中的一个所希望的特征。这是因为如果所述配体固定化在色谱树脂上，则以上特征使得可以例如设计亲和纯化的有效方案；并且在抗体的情况下甚至随后通过免疫技术纯化的中间步骤不依赖于所表达异源蛋白质的性质。
为了获得针对这一稳定子的单克隆抗体(Mab)，用蛋白质TAB13(序列识别号：20)免疫小鼠达到了这一目标。TAB13是一种来源于TAB9的MEP，后者不同于前者之处在于存在两个附加的V3共有区(图9B)：-C6：TSITIGPGQVFYRTG(序列识别号：15)-C8：RQRTSIGQGQALYTT(序列识别号：16)
用类似于有关TAB4和TAB9所描述的方式表达(实施例4)和纯化(实施例6)这一MEP。
然后，经皮下路线用3剂20μg TAB13辅以氢氧化铝以15天间隔免疫小鼠Balb/c。在最后一次用药后20天，经腹膜内路线用在磷酸盐缓冲液中的20μg相同的抗原加强免疫所说动物。将脾细胞与骨髓瘤X63 Ag8 653融合，分离形成的杂交瘤，按照已经建立的方法(Gavilondo，J.V.(编者)，单克隆抗体：理论和实践，Elfos Scientiae，1995，哈瓦那，古巴)检查。
经ELISA(用MEP TAB13，P64K蛋白质或代表TAB13中存在的不同V3区的合成肽涂布平板)，评价由分离的杂交瘤分泌的抗体的反应性。在获得的总共18个阳性克隆中，其中一个(命名为448/30/7)识别TAB13及64K，但不识别来源于gP120的肽。
采用不同的样品(融合到来源于P64K的稳定子上的异源蛋白质(P64K-47)或相同的融合蛋白质或者融合到IL-2的头58个氨基酸上的蛋白质(IL2-58))经Western印迹法测定这一MAb对pM-83稳定子肽的特异性和其用于包含它的蛋白质的免疫检测的可能性。为此，用下列质粒转化(Sambrook，J.，Fritsch，Y.F.和Maniatis，T.，分子克隆：实验室手册，冷泉港实验室出版社，1989，纽约，美国)大肠杆菌菌株MM294：pILM-28(IL2-58+porA)、pM-82(P64K-47+porA)、pTAB13(P64K-47+MEP)、pM-6(P64K)和pFP15(IL-2)。也使用表达质粒pM-134，该质粒含有P64K的头120个氨基酸，其包括在如原有质粒中的相同的调节信号控制下的硫辛酸的结合结构域。用引物1573(序列识别号：2)和2192(序列识别号：4)经PCR扩增这一区段，用酶NcoI和BamHI消化，在同样消化过的质粒pFP15(参见实施例4)中克隆。在有关pTAB4和pTAB9的实施例4中限定的生长条件下获得这些转化体的表达。
图11显示了获得的结果，可以看出由于与质粒pM-6，pM-82，pTAB13和pM134样品的反应性(尽管所有这些蛋白质抗原性不同)，Mab448/30/7识别在稳定子P64K-47内的很可能为线性的表位，这一实验表明这一反应性绝不是由于融合到稳定子上的蛋白质(例如质粒pILM-28和pM-82，在不同的稳定子下两者都携带基因porA)引起的。这证明了这一Mab识别的特异性。
总之，由稳定子P64K-47形成的表达系统，含有它的质粒和Mab448/30/7，使得可以以包含体形式有效合成大量不同蛋白质，它们的检测不需要预先获得针对所表达的各种肽的免疫探针。实施例6：
在选择疫苗候选者表达系统时，对融合到稳定子上的多肽的免疫应答无有害影响是要考虑的一个重要因素。基于稳定子P64K-47表达系统的一个明显优点是其保证以上所述因素的降低的免疫原性(实施例1)。然而，仍通过比较针对存在于MEP TAB4(IL2-22)和TAB9(P64K-47)中的V3区不同肽的抗体反应定量评价了在稳定子P64K-47对融合蛋白免疫反应的影响。
为了表达和纯化TAB4和TAB9，如实施例4所述获得菌株W3110trpA905+pTAB4和W3110trpA905+pTAB9的生物量。在苯甲基磺酰氟(PMSF)和非离子洗涤剂Tritón-X-100存在下用溶菌酶和超声波共同处理裂解生物量。经分级离心获得包含体，用阳离子移变剂(caotrophicagent)和洗涤剂(TAB4：1.尿素4M Trit6n-X-100 1％，2.尿素8M。TAB9：1.尿素8M Tritón-X-100 1％，2.盐酸胍6M)对包含体的两个连续的洗涤循环部分纯化并溶解MEP。通过在高效液相色谱(HPLC)，C4VYDAC柱中通过20-80％乙腈梯度洗脱最终纯化所获得的上清液，纯度达约90％。
以每毫克蛋白质60毫克佐剂的比例将纯化的重组蛋白质辅以氢氧化铝凝胶。将该制剂用于经皮下路线以200μg/剂免疫5组兔。使用充分涂布有用于免疫的MEP或涂布有相应于存在于其上的各V3区的肽的96孔聚苯乙烯平板(高结合，Costar，USA)经ELISA评价免疫反应。用高于原血清混合物两倍的吸收值的各血清的最大稀释度计算滴度。所有血清均以双份分析。
所获得的值(图12)表明，在不同的IL2-22+MEP(TAB4)和P64K-47+MEP(TAB9)之间针对V3区的滴度是类似的。尽管对TAB9的肽识别频率稍高些，但这种差别在统计学上是不显著的(p＜0.05)。总之，异源蛋白质的免疫原性受稳定子P64K-47影响很小，并且可与现行使用的其它表达系统相比。
附图描述：
图1：编码P64K的基因IpdA基因的核苷酸序列。斜体显示插入质粒pM-6的IpdA原本缺乏的序列(欧洲专利申请0474313A2)。
图2：抗P64K肽小鼠多克隆血清的反应性。选择被认为阳性的最小值为0.4光密度单位。
图3：稳定子的氨基酸序列，从质粒pM-6经PCR扩增的DNA序列推定。下划线序列相应于寡核苷酸引物。
图4：构建质粒pM-83的策略。
图5：采用BLASTP程序进行的稳定子序列(“查找”)和SWISS-PROT库中存在的序列(“目标”)之间的同源性检索结果。仅显示了人蛋白质和哺乳动物蛋白质相应的结果。P(N)代表在由随机序列构成的库内发现N等同排列的几率。同源性的显著性随着P(N)值减小。相同的残基用它的单字母代码表示。保守取代用“+”表示，没有显示差异。
图6：采用TBLASTN程序进行的稳定子序列(“查找”)和EMBL数据库序列的所有可能的翻译产物(“目标”)之间的同源性检索结果。仅显示了人蛋白质和哺乳动物蛋白质相应的结果。P(N)代表在由随机序列构成的库内发现N等同排列的几率。同源性的显著性随着P(N)值减小。相同的残基用它的单字母代码表示。保守取代用“+”表示，没有显示差异。
图7：构建质粒pTAB4和pTAB9的策略。
图8：MEP TAB9的核苷酸和氨基酸序列。
图9：A：MEP TAB4和TAB9的总的结构。B：MEP TAB13的总的结构。
图10：基因porA、Opc和MEP在来源于人IL-2或来源于P64K抗原头47个氨基酸的稳定子下表达的比较。
A：比较表，hIL2-58指人类IL-2头58个氨基酸，hIL2-22指头22个氨基酸，P64K-4指来源于P64K抗原头47个氨基酸的稳定子。
B：在质粒TAB4和TAB9中MEP表达的SDS-PAGE比较分析。A道：分子量标记；B道：菌株W3110trpA905的总蛋白质；C道：W3110trpA905+pTAB4的总蛋白质；D道：纯化的TAB4；E道：W3110trpA905+pTAB9的总蛋白质；F：纯化的TAB9。
C：以包含体表达的TAB9。A：样品的可溶性蛋白质。B：不溶性蛋白质或膜蛋白质。
图11：采用Mab448/30/7和大肠杆菌MM294总蛋白质样品进行的Western印迹分析，所述大肠杆菌已由以下质粒转化：1：阴性对照，2：pM-6(P64K)，3：pM-82(P64K-47+porA)，4：pTAB13(P64K-47+MEP)，5：pFP15(IL-2)，6：pM-134(P64K-120)，7：pILM-28(IL2-58+porA)。左边列出了分子量标志。
图12：用TAB4和TAB9免疫的兔ELISA滴度值倒数。MG：抗V3滴度倒数的几何平均值；R：与V3肽的百分反应性。
序列表序列识别号：1
序列类型：氨基酸
长度：47个氨基酸
分子类型：蛋白质片段
性质：脑膜炎奈瑟氏球菌重组蛋白质P64k的头47个氨基酸MLDKRMALVELKVPDIGGHENVDIIAVEVNVGDTIAVDDTLITLETD44序列识别号：2
序列类型：核苷酸
长度：29个碱基
分子类型：合成寡核苷酸
性质：脑膜炎奈瑟氏球菌重组蛋白质P64k的头44个氨基酸的PCR扩增的5’引物No.1573TTCCATGGTAGATAAAAGAATGGCTTTAG 29序列识别号：3
序列类型：核苷酸
长度：29个碱基
分子类型：合成寡核苷酸
性质：脑膜炎奈瑟氏球菌重组蛋白质P64k的头44个氨基酸的PCR扩增的3’引物No.1575TTTCTAGATCCAAAGTAATC AG GGTATCG 29序列识别号：4
序列类型：核苷酸
长度：26个碱基
分子类型：合成寡核苷酸
性质：脑膜炎奈瑟氏球菌重组蛋白质P64k的头120个氨基酸的PCR扩增的3’引物No.2192GGCGGTTCTGCCGATTAAGG ATCCGA 26序列识别号：5
序列类型：核苷酸
长度：146个碱基对
分子类型：PCR扩增片段
性质：脑膜炎奈瑟氏球菌重组蛋白质P64k的头47个氨基酸的衍生片段。限制性位点NcoI(3-8位)和XbaI(139-144位)由PCR引入，其引起这一片段核苷酸序列上的变化
TTCCATGGTAGATAAAAGAATGGCTTTAGTTGAATTGAAAGTGCCCGACATTGGCGGACA 60
CGAAAATGTAGATATTATCGCGGTTGAAGTAAACGTGGGCGACACTATTGCTGTGGACGA 120
TACCCTGATTACTTTGGATCTAGAAA 146序列识别号：6
序列类型：氨基酸
长度：47个氨基酸
分子类型：来源于脑膜炎奈瑟氏球菌重组蛋白质P64k的头47个氨基酸的稳定子片段
性质：与P64k相比，该片段具有下列变化
L2→V2；E45→D45；T46→L46；D47→E47MVDKRMALVELKVPDIGGHENVDIIAVEVNVGDTIAVDDTLITLDLE47序列识别号：7
序列类型：核苷酸
长度：16个碱基
分子类型：合成寡核苷酸CTAGATTTGATATCAG 16序列识别号：8
序列类型：核苷酸
长度：16个碱基
分子类型：合成寡核苷酸GATCCTGATATCAAAT 16序列识别号：9
序列类型：氨基酸
长度：15个氨基酸
分子类型：HIV-1 LR150分离物gp120蛋白质的V3环的中心区SRGIRIGPGRAILAT 15序列识别号：10
序列类型：氨基酸
长度：15个氨基酸
分子类型：HIV-1 JY1分离物gp120蛋白质的V3环的中心区RQSTPIGLGQALYTT 15序列识别号：11
序列类型：氨基酸
长度：15个氨基酸
分子类型：HIV-1 RF分离物gp120蛋白质的V3环的中心区RKSITKGPGRVIYAT 15序列识别号：12
序列类型：氨基酸
长度：15个氨基酸
分子类型：HIV-1 MN分离物gp120蛋白质的V3环的中心区RKRIHIGPGRAFYTT 15序列识别号：13
序列类型：氨基酸
长度：15个氨基酸
分子类型：HIV-1 BRVA分离物gp120蛋白质的V3环的中心区RKRITMGPGRVYYTT 15序列识别号：14
序列类型：氨基酸
长度：15个氨基酸
分子类型：HIV-1 IIIB分离物gp120蛋白质的V3环的中心区SIRIQRGPGRAFVTI 15序列识别号：15
序列类型：氨基酸
长度：15个氨基酸
分子类型：MEP TAB13内7位上，不同HIV-1分离物gp120蛋白质V3环中心区的共有序列TSITIGPGQVFYRTG 15序列识别号：16
序列类型：氨基酸
长度：15个氨基酸
分子类型：MEP TAB13内8位上，不同HIV-1分离物gp120蛋白质V3环中心区的共有序列RQRTSIGQGQALYTT 15序列识别号：17
序列类型：氨基酸
长度：5个氨基酸
分子类型：在MEP TAB3、TAB4、TAB5和TAB13中分开V3表位的柔性接头AGGGA 5序列识别号：18
序列类型：氨基酸
长度：141个氨基酸
分子类型：多表位多肽(MEP)TAB4。MAPTSSSTAQTQLQLEHLLLDLQIFLSRGIRIGPGRAILATAGGGARQSTPIGLGGALYT 60TAGGGARKSITKGPGRVIYATAGGGARKRIHIGPGRAFYTTAGGGARKRITMGPGRVYYT 120TAGGGASIRIQRGPGRAFVTI 141序列识别号：19
序列类型：氨基酸
长度：162个氨基酸
分子类型：多表位多肽(MEP)TAB9MVDKRMALVELKVPDIGGHENVDIIAVEVNVGDTIAVDDTLITLDLDSRGIRIGPGRAIL 60ATAGGGARQSTPIGLGGALYTTAGGGARKSITKGPGRVIYATAGGGARKRIHIGPGRAFY 120TTAGGGARKRITMGPGRVYYTTAGGGASIRIQRGPGRAFVTI 162序列识别号：20
序列类型：氨基酸
长度：202个氨基酸
分子类型：多表位多肽(MEP)TAB13
MVDKRMALVELKVPDIGGHENVDIIAVEVNVGDTIAVDDTLITLDLDSRGIRIGPGRAIL 60
ATAGGGAROSTPIGLGOALYTTAGGGARKSITKGPGRVIYATAGGGARKRIHIGPGRAFY 120
TTAGGGARKRITMGPGRVYYTTAGGGARORTSIGOGOALYTTAGGGATSITIGPGOVFYR 180
TGAGGGASIRIQRGPGRAFVTI 202
序列识别号：21
序列类型：核苷酸
长度：368个碱基对
分子类型：合成寡核苷酸性质：编码在MEP TAB9中由AGGGA间隔的V3表位的核苷酸片段。引入了限制性位点XbaI(1至6位)和BamHI(363至368位)
TCTAGACTCGAGAGGCATTCGTATCGGCCCAGGTCGCGCAATTTTAGCAACAGCTGGCGG 60
TGGCGCACGTCAATCTACCCCTATTGGTTTAGGTCAGGCTCTGTATACGACTGCCGGCGG 120
TGGTGCGCGCAAAAGTATCACCAAGGGTCCAGGCCGCGTCATTTACGCCACCGCGGGCGG 180
CGGTGCCCGTAAGCGTATCCACATTGGCCCAGGCCGTGCATTCTATACTACAGCAGGTGG 240
TGGCGCACGTAAACGCATCACTATGGGTCCTGGTCGCGTCTATTACACGACCGCTGGCGG 300
CGGTGCTAGCATTCGCATCCAACGCGGCCCTGGTCGTGCATTTGTGACCATATGATAACG 360
CGGGATCC 368