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本发明属于生物工程领域,具体涉及一种雷帕霉素的分离纯化方法。针对现有生产技术中存在的工艺繁琐,生产时间周期长,生产成本高,收率低,产品纯度低等不足,本发明提供一种雷帕霉素的提纯方法,利用吸水链霉菌(Streptomyces hygroscopicus ACCC No.40417),通过微生物发酵培养出含雷帕霉素的发酵液,雷帕霉素发酵液经种子培养、接种前准备、接种、多阶段溶氧控制、分批补料发酵阶段,。