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本发明提供了一类新的化合物、包含这类化合物的药物组合物和使用这类化合物来治疗或预防与激酶活性异常或失控有关的疾病或紊乱、特别是涉及Abl、Bcr－Abl、Aurora－A、Axl、BMX、CHK2、c－RAF、cSRC、Fes、FGFR3、Flt3、IKKα、IR、JNK2α2、Lck、Met、MKK6、MST2、p70S6K、PDGFRα、PKA、PKD2、ROCK－II、Ros、Rsk1、SAPK2α、SAPK2β、SAPK3、SAPK4、Syk、Tie2和TrkB激酶异常激活的疾病或紊乱的方法。

1.  式I化合物及其可药用盐、水合物、溶剂化物和异构体：

其中：
Y选自N和CH；
R₁选自氢和C_1-6烷基；
R₂选自氢和C_1-6烷基；或者R₁和R₂与R₁和R₂所连接的苯基环一起形成C_6-10芳基或C_5-10杂芳基；
R₃选自NR₄R₅和X₁R₅；其中X₁选自价键和C_1-4亚烷基；R₄选自氢和C_1-6烷基；R₅选自任选被1-3个基团取代的C_6-10芳基，所述基团独立地选自卤代-C_1-6烷基、C_1-6烷氧基、C_5-10杂芳基-C_0-4烷基和C_3-8杂环烃基-C_0-4烷基；其中所述的R₅的杂芳基和杂环烃基取代基任选被C_1-6烷基取代。

2.  权利要求1的化合物，其中R₁和R₂均为氢，或者R₁和R₂与R₁和R₂所连接的苯基环一起形成喹啉基或萘基。

3.  权利要求2的化合物，其中R₃选自NHR₅和X₁R₅；其中X₁选自价键和亚甲基；R₅选自任选被1-3个基团取代的苯基，所述基团独立地选自三氟-甲基、甲氧基、咪唑基和哌嗪基-甲基；其中所述的R₅的咪唑基或哌嗪基取代基任选被甲基和乙基取代。

4.  权利要求1的化合物，选自：
1-[4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基]-3-(3-三氟甲基-苯基)-脲；
1-[4-(4-乙基-哌嗪-1-基甲基)-3-三氟甲基-苯基]-3-[4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基]-脲；
1-[3-(4-甲基-咪唑-1-基)-5-三氟甲基-苯基]-3-[4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基]-脲；
1-(3，5-二甲氧基-苯基)-3-[4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基]-脲；
1-[4-(9H-嘌呤-6-基氧基)-苯基]-3-(3-三氟甲基-苯基)-脲；
1-[3-(4-甲基-咪唑-1-基)-5-三氟甲基-苯基]-3-[4-(9H-嘌呤-6-基氧基)-苯基]-脲；
1-[4-(4-乙基-哌嗪-1-基甲基)-3-三氟甲基-苯基]-3-[4-(9H-嘌呤-6-基氧基)-苯基]-脲；
1-[5-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-喹啉-8-基]-3-(3-三氟甲基-苯基)-脲；
N-[4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基]-2-(3-三氟甲基-苯基)-乙酰胺；
2-[3-(4-甲基-咪唑-1-基)-5-三氟甲基-苯基]-N-[4-(9H-嘌呤-6-基氧基)-苯基]-乙酰胺；
N-[4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基]-3-三氟甲基-苯甲酰胺；
3-(4-甲基-咪唑-1-基)-N-[4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基]-5-三氟甲基-苯甲酰胺；
N-[4-(9H-嘌呤-6-基氧基)-苯基]-3-三氟甲基-苯甲酰胺；
4-(4-乙基-哌嗪-1-基甲基)-N-[4-(9H-嘌呤-6-基氧基)-苯基]-3-三氟甲基-苯甲酰胺；和
N-[5-(9H-嘌呤-6-基氧基)-喹啉-8-基]-3-三氟甲基-苯甲酰胺。

5.  药物组合物，包含治疗有效量的权利要求1的化合物和可药用的赋形剂。

6.  治疗动物的其中抑制激酶活性可预防、抑制或改善该疾病的病理和/或症状的疾病的方法，该方法包括给所述动物施用治疗有效量的权利要求1的化合物。

7.  权利要求6的方法，其中的激酶选自Abl、Bcr-Abl、Axl、BMX、CHK2、c-RAF、cSRC、Fes、FGFR3、Flt3、IKKα、IR、JNK2α2、Lck、Met、MKK6、MST2、p70S6K、PDGFRα、PKA、PKD2、ROCK-II、Ros、Rsk1、SAPK2α、SAPK2β、SAPK3、SAPK4、Syk、Tie2和TrkB。

8.  权利要求1的化合物在制备药物中的用途，所述的药物用于在动物中治疗其中激酶Abl、Bcr-Abl、Axl、BMX、CHK2、c-RAF、cSRC、Fes、FGFR3、Flt3、IKKα、IR、JNK2α2、Lck、Met、MKK6、MST2、p70S6K、PDGFRα、PKA、PKD2、ROCK-II、Ros、Rsk1、SAPK2α、SAPK2β、SAPK3、SAPK4、Syk、Tie2和TrkB的活性对该疾病的病理和/或症状起作用的疾病。

作为蛋白激酶抑制剂的化合物和组合物
相关申请的交叉参考
本发明根据35U.S.C.§119(e)要求于2005年10月28日提交的美国临时申请60/731,179的优先权。该优先权申请的公开内容整体引入本文作为参考并用于所有目的。
发明背景
发明领域
本发明提供了一类新的化合物、包含这类化合物的药物组合物和使用这类化合物来治疗或预防与激酶活性异常或失控有关的疾病或紊乱、特别是涉及Abl、Bcr-Abl、Aurora-A、Axl、BMX、CHK2、c-RAF、cSRC、Fes、FGFR3、Flt3、IKKα、IR、JNK2α2、Lck、Met、MKK6、MST2、p70S6K、PDGFRα、PKA、PKD2、ROCK-II、Ros、Rsk1、SAPK2α、SAPK2β、SAPK3、SAPK4、Syk、Tie2和TrkB激酶异常激活的疾病或紊乱的方法。

背景
蛋白激酶代表一大家族蛋白质，其在调节广泛多样的细胞过程和维持对细胞功能的控制方面起关键作用。这些激酶非限定性的部分列表包括：受体酪氨酸激酶，例如血小板衍生生长因子受体激酶(PDGF-R)、神经生长因子受体trkB、Met和成纤维细胞生长因子受体FGFR3；非受体酪氨酸激酶如Abl和融合激酶BCR-Abl、Lck、Csk、Fes、Bmx和c-src；以及丝氨酸/苏氨酸激酶，例如b-RAF、c-RAF、sgk、MAP激酶(如MKK4、MKK6等)和SAPK2α、SAPK2β和SAPK3。在许多疾病状态中已经观察到异常的激酶活性，包括良性和恶性增殖性紊乱以及免疫和神经系统不恰当的激活导致的疾病。
本发明的新化合物抑制一种或多种蛋白激酶的活性，因此预期可用于治疗与激酶相关的疾病。
发明概述
在一个方面，本发明提供了式I化合物及其N-氧化物衍生物、前药衍生物、被保护的衍生物、单一异构体及异构体混合物以及这类化合物的可药用的盐和溶剂化物(例如水合物)，

其中：
Y选自N和CH；
R₁选自氢和C_1-6烷基；
R₂选自氢和C_1-6烷基；或者R₁和R₂与R₁和R₂所连接的苯基环一起形成C_6-10芳基或C_5-10杂芳基；
R₃选自NR₄R₅和X₁R₅；其中X₁选自价键和C_1-4亚烷基；R₄选自氢和C_1-6烷基；R₅选自任选被1-3个基团取代的C_6-10芳基，所述基团独立地选自卤代-C_1-6烷基、C_1-6烷氧基、C_5-10杂芳基-C_0-4烷基和C_3-8杂环烃基-C_0-4烷基；其中所述的R₅的杂芳基和杂环烃基取代基任选被C_1-6烷基取代。
在第二方面，本发明提供了含有与一种或多种适宜赋形剂混合的式I化合物或其N-氧化物衍生物、单一异构体及异构体混合物或者它们的可药用盐的药物组合物。
在第三方面，本发明提供了治疗动物的其中抑制激酶活性、特别是抑制Abl、Bcr-Abl、Aurora-A、Axl、BMX、CHK2、c-RAF、cSRC、Fes、FGFR3、Flt3、IKKα、IR、JNK2α2、Lck、Met、MKK6、MST2、p70S6K、PDGFRα、PKA、PKD2、ROCK-II、Ros、Rsk1、SAPK2α、SAPK2β、SAPK3、SAPK4、Syk、Tie2和/或TrkB的活性可以预防、抑制或改善疾病的病理和/或症状的疾病的方法，该方法包括给动物施用治疗有效量的式I化合物或其N-氧化物衍生物、单一异构体及异构体混合物或者它们的可药用盐。
在第四方面，本发明提供了式I化合物在制备药物中的用途，所述的药物用于在动物中治疗其中激酶的活性、特别是Abl、Bcr-Abl、Aurora-A、Axl、BMX、CHK2、c-RAF、cSRC、Fes、FGFR3、Flt3、IKKα、IR、JNK2α2、Lck、Met、MKK6、MST2、p70S6K、PDGFRα、PKA、PKD2、ROCK-II、Ros、Rsk1、SAPK2α、SAPK2β、SAPK3、SAPK4、Syk、Tie2和/或TrkB的活性对该疾病的病理和/或症状起作用的疾病。
在第五方面，本发明提供了制备式I化合物及其N-氧化物衍生物、前药衍生物、被保护的衍生物、单一异构体及异构体混合物以及它们的可药用盐的方法。
发明详述
定义
“烷基”作为基团和作为其它基团(例如卤素取代的烷基和烷氧基)的结构元件，可以是直链的或支链的。C_1-4烷氧基包括甲氧基、乙氧基等等。卤素取代的烷基包括三氟甲基、五氟乙基等等。
“芳基”表示含有六至十个环碳原子的单环或稠合双环芳香环系。例如，芳基可以是苯基或萘基，优选苯基。“亚芳基”表示衍生自芳基的二价基团。
“杂芳基”如上文芳基中定义，其中一个或多个环成员为杂原子。例如杂芳基包括吡啶基、吲哚基、吲唑基、喹喔啉基、喹啉基、苯并呋喃基、苯并吡喃基、苯并噻喃基、苯并[1，3]二氧杂环戊烯、咪唑基、苯并咪唑基、嘧啶基、呋喃基、噁唑基、异噁唑基、三唑基、四唑基、吡唑基、噻吩基等。
“环烃基”表示含有指定数目环原子的饱和或部分不饱和的单环、稠合双环或桥连多环系。例如，C_3-10环烃基包括环丙基、环丁基、环戊基、环己基等。
“杂环烃基”表示如本申请所定义的环烃基，条件是一个或多个指定的环原子被选自-O-、-N＝、-NR-、-C(O)-、-S-、-S(O)-或-S(O)₂-的基团代替，其中R是氢、C_1-4烷基或氮保护基。例如，被用于本申请来描述本发明化合物的C_3-8杂环烃基包括吗啉代基、吡咯烷基、吡咯烷基-2-酮、哌嗪基、哌啶基、哌啶酮基(piperidinylone)、1，4-二氧杂-8-氮杂-螺[4.5]癸-8-基等。
“卤素”(或卤代基)优选代表氯或氟，但也可以是溴或碘。
“激酶名单”是包括如下激酶的激酶名单：Abl(人)、Abl(T315I)、JAK2、JAK3、ALK、JNK1α1、ALK4、KDR、Aurora-A、Lck、Blk、MAPK1、Bmx、MAPKAP-K2、BRK、MEK1、CaMKII(大鼠)、Met、CDK1/细胞周期蛋白B、p70S6K、CHK2、PAK2、CK1、PDGFRα、CK2、PDK1、c-kit、Pim-2、c-RAF、PKA(h)、CSK、PKBα、cSrc、PKCα、DYRK2、Plk3、EGFR、ROCK-I、Fes、Ron、FGFR3、Ros、Flt3、SAPK2α、Fms、SGK、Fyn、SIK、GSK3β、Syk、IGF-1R、Tie-2、IKKβ、TrKB、IR、WNK3、IRAK4、ZAP-70、ITK、AMPK(大鼠)、LIMK1、RsK2、Axl、LKB1、SAPK2β、BrSK2、Lyn(h)、SAPK3、BTK、MAPKAP-K3、SAPK4、CaMKIV、MARK1、Snk、CDK2/细胞周期蛋白A、MINK、SRPK1、CDK3/细胞周期蛋白E、MKK4(m)、TAK1、CDK5/p25、MKK6(h)、TBK1、CDK6/细胞周期蛋白D3、MLCK、TrkA、CDK7/细胞周期蛋白H/MAT1、MRCKβ、TSSK1、CHK1、MSK1、Yes、CK1d、MST2、ZIPK、c-Kit(D816V)、MuSK、DAPK2、NEK2、DDR2、NEK6、DMPK、PAK4、DRAK1、PAR-1Bα、EphA1、PDGFRβ、EphA2、Pim-1、EphA5、PKBβ、EphB2、PKCβI、EphB4、PKCδ、FGFR1、PKCη、FGFR2、PKCθ、FGFR4、PKD2、Fgr、PKG1β、Flt1、PRK2、Hck、PYK2、HIPK2、Ret、IKKα、RIPK2、IRR、ROCK-II(人)、JNK2α2、Rse、JNK3、Rsk1(h)、PI3Kγ、PI3Kδ和PI3-Kβ。根据该激酶名单(野生型和/或其突变体)筛选出本发明化合物，其抑制至少一种所述名单成员的活性。
“BCR-Abl突变体形式”表示野生型序列的单一或多个氨基酸改变。BCR-ABL的突变通过破坏蛋白质与抑制剂(例如Gleevec等)之间的关键接触点而发挥作用，更经常地通过诱导从无活性状态向活性状态、也就是BCR-ABL与Gleevec不能结合的构型的转变而发挥作用。根据临床样品的分析，被发现与抗性表型有关的突变的总数已经随时间的推移缓慢但不可抗拒地增加。突变似乎聚集在四个主要的区域。一组突变(G250E、Q252R、Y253F/H、E255K/V)包括构成ATP的磷酸-结合袢(也称为P-袢)的氨基酸。第二组(V289A、F311L、T315I、F317L)可在Gleevec结合位点处发现，经由氢键或范德华力直接与抑制剂相互作用。第三组突变(M351T、E355G)聚集在催化结构域附近。第四组突变(H396R/P)位于活化袢中，它的构型是控制激酶活化/失活的分子开关。在CML和ALL患者中检测到的与Gleevec有关的BCR-ABL点突变包括：M224V、L248V、G250E、G250R、Q252R、Q252H、Y253H、Y253F、E255K、E255V、D276G、T277A、V289A、F311L、T315I、T315N、F317L、M343T、M315T、E355G、F359V、F359A、V379I、F382L、L387M、L387F、H396P、H396R、A397P、S417Y、E459K和F486S(单个字母代码所示的氨基酸位置是用于基因库(GenBank)序列的那些，登录号AAB60394，相应于ABL型1a；Martinelli等，Haematologica/The Hematology Journal，2005年4月；90-4)。除非本发明另有规定，Bcr-Abl表示该酶的野生型和突变体形式。
“治疗”涉及减轻或缓解疾病和/或其伴随症状的方法。
优选实施方案的描述
本发明提供了用于治疗与激酶相关的疾病、特别是与Abl、Bcr-Abl、Aurora-A、Axl、BMX、CHK2、c-RAF、cSRC、Fes、FGFR3、Flt3、IKKα、IR、JNK2α2、Lck、Met、MKK6、MST2、p70S6K、PDGFRα、PKA、PKD2、ROCK-II、Ros、Rsk1、SAPK2α、SAPK2β、SAPK3、SAPK4、Syk、Tie2和TrkB激酶相关的疾病的化合物、组合物和方法。例如，可以通过抑制Bcr-Abl的野生型和突变型来治疗与BCR-Abl相关的白血病和其它增殖性紊乱。
在一项实施方案中，涉及其中R₁和R₂均为氢的式I化合物。
在另一项实施方案中，R₁和R₂与R₁和R₂所连接的苯基环一起形成喹啉基或萘基。
在另一项实施方案中，R₃选自NHR₅和X₁R₅；其中X₁选自价键和亚甲基；R₅选自任选被1-3个基团取代的苯基，所述基团独立地选自三氟-甲基、甲氧基、咪唑基和哌嗪基-甲基；其中所述的R₅的咪唑基或哌嗪基取代基任选被甲基和乙基取代。
优选的本发明化合物选自：
1-[4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基]-3-(3-三氟甲基-苯基)-脲；
1-[4-(4-乙基-哌嗪-1-基甲基)-3-三氟甲基-苯基]-3-[4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基]-脲；
1-[3-(4-甲基-咪唑-1-基)-5-三氟甲基-苯基]-3-[4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基]-脲；
1-(3，5-二甲氧基-苯基)-3-[4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基]-脲；
1-[4-(9H-嘌呤-6-基氧基)-苯基]-3-(3-三氟甲基-苯基)-脲；
1-[3-(4-甲基-咪唑-1-基)-5-三氟甲基-苯基]-3-[4-(9H-嘌呤-6-基氧基)-苯基]-脲；
1-[4-(4-乙基-哌嗪-1-基甲基)-3-三氟甲基-苯基]-3-[4-(9H-嘌呤-6-基氧基)-苯基]-脲；
1-[5-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-喹啉-8-基]-3-(3-三氟甲基-苯基)-脲；
N-[4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基]-2-(3-三氟甲基-苯基)-乙酰胺；
2-[3-(4-甲基-咪唑-1-基)-5-三氟甲基-苯基]-N-[4-(9H-嘌呤-6-基氧基)-苯基]-乙酰胺；
N-[4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基]-3-三氟甲基-苯甲酰胺；
3-(4-甲基-咪唑-1-基)-N-[4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基]-5-三氟甲基-苯甲酰胺；
N-[4-(9H-嘌呤-6-基氧基)-苯基]-3-三氟甲基-苯甲酰胺；
4-(4-乙基-哌嗪-1-基甲基)-N-[4-(9H-嘌呤-6-基氧基)-苯基]-3-三氟甲基-苯甲酰胺；和
N-[5-(9H-嘌呤-6-基氧基)-喹啉-8-基]-3-三氟甲基-苯甲酰胺。
其它优选的本发明化合物在下文实施例和表I中详述。
药理学和效用
本发明的化合物调节激酶的活性，本身可用于治疗其中激酶对该疾病病理学和/或症候学有作用的疾病或紊乱。被本文所述的化合物和组合物抑制的以及可通过本文所述的方法有对抗用的激酶的实例包括但不限于Abl、Bcr-Abl(野生型和突变型)、Aurora-A、Axl、BMX、CHK2、c-RAF、eSRC、Fes、FGFR3、Flt3、IKKα、IR、JNK2α2、Lck、Met、MKK6、MST2、p70S6K、PDGFRα、PKA、PKD2、ROCK-II、Ros、Rsk1、SAPK2α、SAPK2β、SAPK3、SAPK4、Syk、Tie2和TrkB。
Abelson酪氨酸激酶(即Abl，c-Abl)参与细胞周期的调控、对基因毒性应激的细胞应答，并通过整联蛋白发信号来参与有关细胞环境的信息传递。大体上，Abl蛋白作为这样一种细胞模块来起复杂作用：该细胞模块整合多种胞外和胞内来源的信号并影响关于细胞周期和凋亡的决定。Abelson酪氨酸激酶包括多种亚型衍生物，例如具有失控的酪氨酸激酶活性的嵌合融合体(癌蛋白)BCR-Abl或v-Abl。BCR-Abl在95％的慢性髓性白血病(CML)和10％的急性淋巴细胞白血病的发病机制中是重要的。STI-571(Gleevec)是致癌的BCR-Abl酪氨酸激酶的抑制剂，可用于治疗慢性髓性白血病(CML)。但是，有些处于CML原始细胞危象期的患者由于BCR-Abl激酶中的突变而对STI-571有抗性。迄今为止，已报道了超过22种的突变体，最常见的是G250E、E255V、T315I、F317L和M351T。
本发明的化合物抑制abl激酶、尤其是v-abl激酶。本发明的化合物还抑制野生型BCR-Abl激酶和BCR-Abl激酶的突变体，因此适于治疗BCR-Abl阳性癌症和肿瘤疾病，例如白血病(尤其是慢性髓性白血病和急性淋巴细胞白血病，其中尤其发现有细胞凋亡的作用机制)，它们还表现出对白血病干细胞亚群的作用以及在抽取上述细胞(例如抽取骨髓)后体外纯化这些细胞和清除癌细胞后再移植这些细胞(例如经纯化骨髓细胞的再移植)的可能性。
疟疾由疟原虫属(Plasmodium)的原生动物寄生虫引起。疟原虫属的四个种可以产生各种形式的疾病：恶性疟原虫(Plasmodium falciparum)；间日疟原虫(Plasmodium vivax)；卵形疟原虫(Plasmodium ovale)；和三日疟原虫(Plasmodium malaria)。最广泛分布和最危险的恶性疟原虫如果未进行治疗的话可导致致命的脑型疟。蛋白酪氨酸激酶活性分布在恶性疟原虫寄生虫成熟的所有阶段，本发明的激酶抑制剂可用于治疗疟原虫属相关性疾病。本发明的酪氨酸激酶抑制剂、特别是c-kit抑制剂可以是通过抑制恶性疟原虫的生长来治疗疟原虫属相关性疾病的途径。下文的体外分析用作确定本发明的化合物对抗各种疟原虫虫株的活性的手段。
Ras-Raf-MEK-ERK信号通路介导了对生长信号的细胞应答。在约15％的人类癌症中，Ras突变为致癌形式。Raf家族属于丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，它包括三个成员，A-Raf、B-Raf、C-Raf(或Raf-1)。Raf作为药物靶点的焦点集中于Raf作为Ras的下游效应子的关系上。但是，近来的数据显示，B-Raf可能在特定肿瘤的形成中具有重要地位，而不需要活化的Ras等位基因(Nature 417，949-954(2002年7月1日))。特别是已经在很大比例的恶性黑素瘤中检测出B-Raf突变。
对黑素瘤的现有医学治疗效力有限，尤其是对于晚期黑素瘤而言。本发明的化合物还抑制涉及b-Raf激酶的细胞过程，提供了治疗人类癌症、尤其是黑素瘤的新的治疗机会。
本发明的化合物还抑制涉及c-Raf激酶的细胞过程。c-Raf由ras癌基因活化，其在大量的人类癌症中发生突变。因此，抑制c-Raf激酶活性能提供一条途径来防止ras介导的肿瘤生长[Campbell，S.L.，Oncogene，17，1395(1998)]。
PDGF(血小板衍生生长因子)是非常常见的生长因子，它在正常生长和病理细胞增殖中均起重要作用，例如致癌作用和在血管平滑肌细胞疾病中可见，例如动脉粥样硬化和血栓形成。本发明的化合物能够抑制PDGF受体(PDGFR)的活性，因此适于治疗肿瘤疾病，例如神经胶质瘤、肉瘤、前列腺肿瘤以及结肠、乳房、卵巢肿瘤。
本发明的化合物不仅可用作肿瘤抑制物质(例如在小细胞肺癌中)，而且还可用作治疗非恶性增殖性紊乱(例如动脉粥样硬化、血栓形成、银屑病、硬皮病、纤维变性)、保护干细胞(例如抵抗化疗剂如5-氟尿嘧啶的血毒素作用)和治疗哮喘的药物。本发明的化合物尤其可用于治疗对抑制PDGF受体激酶有响应的疾病。
本发明的化合物在治疗移植引起的紊乱中表现出有用效用，例如在同种异体移植、尤其是组织排斥中，例如尤其是闭塞性细支气管炎(OB)，即同种异体肺移植的慢性排斥。与未患OB的人相比，OB患者的支气管肺泡灌洗液中的PDGF浓度较高。
本发明的化合物还对与血管平滑肌细胞迁移和增殖相关的疾病(其中PDGF和PDGF-R通常也起作用)有效，例如再狭窄和动脉粥样硬化。这类对血管平滑肌细胞增殖和迁移的体外和体内作用及其结果可以通过本发明化合物的施用得到证明，还可通过观察其对于体内血管内膜在机械损伤后的增厚的作用而得到证明。
神经营养受体的trk家族(trkA、trkB、trkC)促进神经和非神经组织的存活、生长和分化。TrkB蛋白可以在下列细胞中有表达：在小肠和结肠的神经内分泌型细胞中、在胰腺的α细胞中、在淋巴结和脾脏的单核细胞和巨嗜细胞中以及表皮颗粒层中(Shibayama和Koizumi，1996)。TrkB蛋白的表达与Wilms肿瘤和成神经细胞瘤的不良发展有关。而且，TkrB可以在癌性前列腺细胞中有表达，但在正常细胞中不会表达。信号通路下游的trk受体通过Shc、活化的Ras、ERK-1和ERK-2基因参与了MAPK激活级联反应和PLC-gammal转导通路(Sugimoto等，2001)。
激酶c-Src传导了许多受体的致癌基因信号。例如，肿瘤中EGFR或HER₂/neu的过度表达导致c-Src的组成性激活，它是恶性细胞所特有的，而在正常细胞中没有。另一方面，小鼠c-Src表达的缺乏具有骨石化的表型，这说明c-Src在破骨细胞功能中起到了关键作用，并且可能与相关的疾病有关。
Tec家族的激酶Bmx是一种非受体蛋白质-酪氨酸激酶，控制着乳房上皮癌细胞的增殖。
成纤维细胞生长因子受体3对骨生长具有负面调节作用，并抑制软骨细胞增殖。导致死亡的发育异常是成纤维细胞生长因子受体3的不同突变导致的，一种突变型，TDII FGFR3，具有组成性酪氨酸激酶活性，它能够激活转录因子Stat1，导致细胞-循环抑制剂表达，生长停止和异常骨发育(Su等，Nature，1997，386，288-292)。FGFR3也经常在多种骨髓瘤型癌症中表达。FGFR3活性的抑制剂可用于治疗T-细胞介导的炎症或自身免疫性疾病，包括但不限于类风湿性关节炎(RA)、胶原II型关节炎、多发性硬化症(MS)、系统性红斑狼疮(SLE)、银屑病、青少年型糖尿病、舍格伦病、甲状腺疾病、肉状瘤病、自身免疫性色素层炎、炎性肠病(节段性回肠炎和溃疡性结肠炎)、麸质过敏症(celiac disease)和重症肌无力。
血清和糖皮质激素-调节的激酶(SGK)的活性与紊乱的离子通道活性有关，特别是那些钠和/或钾通道，因此本发明化合物可以用于治疗高血压。
Lin等人((1997)J.Clin.Invest.100，8：2072-2078)和P.Lin(1998，PNAS 95，8829-8834)已经证明：在腺病毒感染期间或对乳房肿瘤和黑素瘤异种移植物模型的Tie-2(Tek)细胞外结构域注射期间，肿瘤生长和血管形成受到抑制，并且肺转移降低。Tie2抑制剂可以在新血管形成不当时使用，即，在糖尿病性视网膜病、慢性炎症、银屑病、卡波西肉瘤、黄斑变性导致的慢性新血管形成、类风湿性关节炎、婴儿血管瘤和癌症中。
Lck在T-细胞信号中起作用。缺乏Lck基因的小鼠形成胸腺细胞的能力很差。作为T-细胞信号正向激活剂的Lck功能表明Lck抑制剂可以用于治疗自身免疫性疾病，例如类风湿性关节炎。
JNK类及其它MAPK类在介导细胞对下列疾病的响应中起作用：癌症、凝血酶诱导的血小板聚积、免疫缺陷性疾病、自身免疫性疾病、细胞凋亡、过敏症、骨质疏松症及心脏病。与JNK通路激活有关的治疗靶疾病包括慢性骨髓性白血病(CML)、类风湿性关节炎、哮喘、骨关节炎、局部缺血、癌症和神经退行性疾病。由于JNK激活的重要的结果是与肝病和肝缺血有关，所以本发明化合物也可以用于治疗各种肝脏疾病。JNK在心血管疾病(例如心肌梗塞或充血性心衰)中的作用已有报道，它表明JNK对各种形式的心脏应激都会介导较大的响应。已经证明JNK级联在T-细胞活化中也起作用，包括IL-2启动子的激活。所以，JNK抑制剂在改变病理性免疫响应中具有治疗价值。在各种癌症中，JNK活化的作用也已经被确定，从而提示了JNK抑制剂在癌症中的可能的应用。例如，组成性活化的JNK与HTLV-1介导的肿瘤发生有关[Oncogene 13：135-42(1996)]。JNK可能在卡波西肉瘤(KS)中也起作用。与KS增殖有关的其它细胞因子的其它增殖作用可能也是由JNK介导的，例如，血管内皮生长因子(VEGF)、IL-6及TNFα。另外，在p210BCR-ABL转化细胞中c-jun基因的调节相应于JNK活性，这表明JNK抑制剂在治疗慢性骨髓性白血病(CML)中的作用[Blood 92：2450-60(1998)]。
据认为某些异常增殖病症与raf表达有关，所以认为应该对raf表达的抑制有响应。Raf蛋白的异常高水平表达也与转化及异常的细胞增殖有关。这些异常增殖病症也被认为对raf表达的抑制有响应。例如，因为已经报道所有肺癌细胞系中的60％表现出异常高水平的c-raf mRNA和蛋白，所以相信c-raf蛋白的表达在异常细胞增殖中起作用。异常增殖性病症的另外的实例为过度增殖性疾病，例如癌症、肿瘤、增生、肺纤维化、血管生成、银屑病；动脉粥样硬化和血管中平滑肌细胞增殖，例如狭窄或血管成形术后的再狭窄。Raf参与其中的细胞信号通路也与以T-细胞增殖(T-细胞活化和生长)为特征的炎性疾病有关，例如，如组织移植排斥、内毒素性休克和肾小球肾炎。
应激活化蛋白激酶(SAPK)是蛋白激酶的一个家族，它代表了信号转导通路的倒数第二步，导致c-jun转录因子的活化和c-jun调节的基因的表达。c-jun尤其与基因的转录有关，该基因对参与DNA修复的蛋白进行编码，该DNA由于基因毒性损伤而被破坏。所以，在细胞中抑制SAPK活性的药物能够阻止DNA修复并使得细胞对导致DNA破坏或抑制DNA合成并诱导细胞凋亡的物质或抑制细胞增殖的物质敏感。
促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)是保守信号转导通路的组成部分，它激活对各种细胞外信号有响应的转录因子、转译因子及其它靶分子。通过促分裂原活化蛋白激酶激酶(MKK)，在具有Thr-X-Tyr序列的双磷酸化基序上，MAPK被磷酸化作用激活。在高级真核细胞中，MAPK信号的生理学作用与细胞事件有关，例如增殖、瘤形成、发展及分化。因此，通过这些通路(尤其是通过MKK4和MKK6)调节信号转导的能力能够使得与MAPK信号有关的人类疾病(例如炎性疾病、自身免疫性疾病和癌症)的治疗和预防性治疗得到发展。
人核糖体S6蛋白激酶家族由至少8种成员组成(RSK1、RSK2、RSK3、RSK4、MSK1、MSK2、p70S6K和p70S6Kb)。核糖体S6蛋白激酶起重要的pleotropic功能，其中之一是在蛋白质生物合成期间mRNA翻译调节中的关键作用(Eur.J.Biochem 2000年11月；267(21)：6321-30，Exp CellRes.1999年11月25日；253(1)：100-9，Mol Cell Endocrinol.1999年5月25日；151(1-2)：65-77)。S6核糖体蛋白被p70S6的磷酸化也已在细胞游动性的调节(Immunol.Cell Biol.2000年8日；78(4)：447-51)和细胞生长(Prog.Nucleic Acid Res.Mol.Biol.，2000；65：101-27)中有牵连，因此可以在肿瘤转移、免疫应答和组织修复以及其它疾病状态中有重要意义。
SAPK′s(也称为“jun N-末端激酶”或“JNK′s”)是代表导致c-jun转录因子活化和受c-jun调节的基因的表达的信号转导途径中倒数第二步的蛋白激酶家族。确切而言，c-jun参与基因的转录，该基因编码参与因遗传毒性受损的DNA的修复的蛋白质。抑制细胞中SAPK活性的物质可防止DNA修复，使细胞对那些通过诱导DNA损伤发挥作用的癌症治疗模式敏感。
BTK在自身免疫和/或炎性疾病中起作用，例如系统性红斑狼疮(SLE)、类风湿性关节炎、多发性血管炎(multiple vasculitides)、特发性血小板减少性紫癜(ITP)、重症肌无力和哮喘。由于BTK在B-细胞活化中的作用，所以BTK抑制剂可用作B-细胞介导的致病活性(如自身抗体产生)的抑制剂，并用于治疗B-细胞淋巴瘤和白血病。
CHK2为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶的关卡激酶家族的一员，参与了DNA损坏的监督机制，例如环境致突变原和内在的活性氧簇所导致的损坏。因此，它可以作为肿瘤抑制物和癌症治疗的靶物质。
CSK影响了癌症细胞的转移能力，特别是结肠癌。
Fes为非-受体蛋白酪氨酸激酶，它与各种细胞因子信号传导通路以及骨髓细胞的分化有关。Fes也是粒细胞分化机制的关键成分。
Flt3受体酪氨酸激酶的活性与白血病和骨髓增生异常综合征有关。约25％的AML白血病细胞在细胞的表面上表达自磷酸化(p)FLT3酪氨酸激酶的组成性活性形式。p-FLT3的活性使得白血病细胞能够生长和存活。急性白血病患者(其白血病细胞表达p-FLT3激酶活性)具有较差的总体临床效果。p-FLT3激酶活性的抑制诱导了白血病细胞的细胞凋亡(编程性细胞死亡)。
IKKα和IKKβ的抑制剂(1和2)用于治疗下列疾病：类风湿性关节炎、移植排斥反应、炎性肠病、骨关节炎、哮喘、慢性阻塞性肺部疾病、动脉粥样硬化、银屑病、多发性硬化症、中风、系统性红斑狼疮、阿尔茨海默病、脑缺血、外伤性脑损伤、帕金森病、肌萎缩性侧索硬化、蛛网膜下出血或其它与脑内和中枢神经系统内炎症介质的过量产生有关的疾病或紊乱。
Met与主要的人类癌症的大多数类型有关，其表达通常与较差的预后和转移有关。Met抑制剂用于治疗包括癌症的疾病，例如肺癌、NSCLC(非小细胞肺癌)、骨癌、胰腺癌、皮肤癌、头颈癌、皮肤或眼内黑素瘤、子宫癌、卵巢癌、直肠癌、肛门癌、胃癌、结肠癌、乳癌、妇科肿瘤(如子宫肉瘤、输卵管癌、子宫内膜癌、子宫颈癌、阴道癌或外阴癌)、霍奇金病、食道癌症、小肠癌、内分泌系统癌症(例如甲状腺癌、甲状旁腺或肾上腺癌)、软组织肉瘤、尿道癌、阴茎癌、前列腺癌症、慢性或急性白血病、儿童实体瘤、淋巴细胞淋巴瘤、膀胱癌、肾或输尿管癌症(例如肾细胞癌、肾盂癌)、儿科恶性肿瘤、中枢神经系统瘤(例如原发性CNS淋巴瘤、脊柱肿瘤、脑干神经胶质瘤或垂体腺瘤)、血癌(例如急性骨髓性白血病、慢性骨髓性白血病等)、Barrett食管(癌前综合征)、赘生性皮肤疾病、银屑病、蕈样霉菌病(mycoses fungoides)和良性前列腺肥大、糖尿病相关的疾病(例如糖尿病性视网膜病、视网膜缺血和视网膜新血管化)、肝硬化、心血管疾病(例如动脉粥样硬化)、免疫性疾病(例如自身免疫性疾病)和肾脏疾病。优选疾病为癌症(例如急性骨髓性白血病)和结肠直肠癌。
Nima-相关的激酶2(Nek2)为细胞循环调节的蛋白激酶，当位于细胞中心体的有丝分裂开始时它具有最大活性。功能研究表明Nek2调节细胞中心体的分离和纺锤体的形成。在衍生自一系列人类肿瘤(包括子宫颈、卵巢、前列腺肿瘤，尤其是乳房肿瘤)的细胞系中，Nek2蛋白提高了2-5倍。
p70S6K介导的疾病或病症包括但不限于增殖性疾病，例如癌症和结节性硬化症。
根据前述，本发明还提供了在需要这类治疗的受治疗者中预防或治疗上面所述的任何疾病或紊乱的方法，该方法包括对所述受治疗者给予治疗有效量的式I化合物或其可药用盐(见“给药和药物组合物”)。对于任何一种上述用途，所需剂量根据给药方式、所治疗的具体病症和预期效果而变化。
给药和药物组合物
一般而言，可以采用任何本领域众所周知的常用和可接受的给药方式(单独或与一种或多种治疗药组合)来施用治疗有效量的本发明化合物。治疗有效量可根据疾病的严重性、受治疗者的年龄和相关健康状况、所用化合物的效力和其它因素而有较大改变。一般而言，以约0.03至2.5mg/kg体重的日剂量全身施用可获得满意的结果。较大型哺乳动物(例如人类)的指示日剂量范围为约0.5mg至约100mg，方便地以例如一天至多四次的分开剂量或以缓释的形式施用。适于口服给药的单位剂量形式包含约1mg至50mg活性成分。
本发明的化合物可以作为药物组合物通过任何常规的途径来给药，具体而言，经肠内给药，例如口服(如以片剂或胶囊形式)；或胃肠道外给药，例如以注射用溶液或混悬液的形式；局部给药，例如以洗液、凝胶、软膏或乳膏剂的形式，或以经鼻施用或栓剂的形式。包含游离形式或可药用盐形式的本发明化合物与至少一种可药用载体或稀释剂的药物组合物可用常规的方式通过混合、制粒或包衣的方法进行制备。例如，口服组合物可以是片剂或明胶胶囊，包含活性成分与a)稀释剂，例如乳糖、葡萄糖、蔗糖、甘露醇、山梨醇、纤维素和/或甘氨酸；b)润滑剂，例如二氧化硅、滑石粉、硬脂酸、硬脂酸镁或钙和/或聚乙二醇；对于片剂还包含c)粘合剂，例如硅酸镁铝、淀粉糊、明胶、西黄蓍胶、甲基纤维素、羧甲基纤维素钠和/或聚乙烯吡咯烷酮；如果期望的话，还包含d)崩解剂，例如淀粉、琼脂、海藻酸或其钠盐或泡腾合剂；和/或e)吸收剂、着色剂、矫味剂和甜味剂。注射用组合物可以是水性等张溶液或混悬液，栓剂可以由含脂肪的乳剂或混悬剂来制备。该组合物可以是无菌的和/或含有佐剂，例如防腐剂、稳定剂、润湿剂或乳化剂、溶解促进剂、调节渗透压的盐和/或缓冲剂。此外，它们还可含有其它有治疗价值的物质。适于透皮应用的制剂包含有效量的本发明化合物和载体。载体包含可吸收的药理学可接受的溶剂以帮助穿过宿主皮肤。例如，透皮装置是包含背衬膜、储库和确保装置在皮肤上的手段的绷带剂形式，其中储库含有化合物，任选含有载体，任选有控速屏障以在延长时间内向宿主皮肤以控制和可预定的速率传送化合物。还可以使用基质透皮制剂。适于局部应用、例如用于皮肤和眼的制剂优选是本领域众所周知的水性溶液、软膏、乳膏剂或凝胶。这些制剂可含有助溶剂、稳定剂、张力增强剂、缓冲剂和防腐剂。
本发明的化合物可以以治疗有效量与一种或多种治疗剂组合(药物组合物)施用。例如，与其它免疫调节或抗炎物质组合可产生协同作用，例如当与以下药物组合时：环孢霉素、雷帕霉素或子囊霉素，或其免疫抑制类似物，例如环孢素A(CsA)、环孢素G、FK-506、雷帕霉素或相当的化合物、皮质类固醇、环磷酰胺、咪唑嘌呤、甲氨蝶呤、布喹那、来氟米特、咪唑立宾、麦考酚酸、麦考酚酸吗乙酯、15-脱氧精胍菌素，免疫抑制抗体、尤其是白细胞受体的单克隆抗体，例如MHC、CD2、CD3、CD4、CD7、CD25、CD28、B7、CD45、CD58或它们的配体，或其它免疫调节化合物，例如CTLA41g。当本发明的化合物与其它疗法组合施用时，共同给药的化合物的剂量自然要取决于所共用药物的类型、所用具体药物以及所治疗病症等而变化。
本发明还提供了药物组合，例如药盒，包含a)第一种药物，它是如本文所公开的游离形式或可药用盐形式的本发明化合物，和b)至少一种共用药物。该药盒可以包含其施用说明书。
如本文所用的术语“共同施用”或“组合施用”等意欲囊括对单独患者施用所选择的治疗药物，并且意欲包括其中药物不一定以同一施用途径或在同一时间施用的治疗方案。
如本文所用的术语“药物组合”指将多于一种活性成分混合或合并所得的产品，包括活性成分的固定和非固定组合。术语“固定组合”指活性成分，例如式I化合物和共用药物，以单一实体或剂量同时施用于患者。术语“非固定组合”指活性成分，例如式I化合物和共用药物，以单独的实体同时、共同或无特定时间限制地依次施用于患者，其中这种施用为患者体内提供了两种化合物的治疗有效水平。后者还用于鸡尾酒疗法，例如给予3种或3种以上的活性成分。
制备本发明化合物的方法
本发明还包括本发明化合物的制备方法。在所述反应中，有必要保护在终产物中期望存在的官能团，例如羟基、氨基、亚氨基、硫代或羧基，从而避免它们不被期望地参与反应。常规的保护基团可以按照标准惯例来使用，例如参见T.W.Greene和P.G.M.Wuts的“有机化学中的保护基团”(Protective Groups in Organic Chemistry，约翰.威利公司(John Wiley andSons)，1991)。
式I化合物可以通过如下反应流程I来制备：
反应流程I

其中Y、R₁、R₂和R₃如发明概述中所定义。式I化合物可以通过使式2化合物与式3化合物在适宜溶剂(例如DMF、二氯甲烷、甲苯等)、适宜碱(例如三乙胺、DIPEA、Na₂CO₃等)和适宜偶联剂(例如DCC、HATU等)的存在下反应来合成。该反应在约0℃至约50℃的温度下进行，并且可以花费一直到约24小时以完成反应。
合成式I化合物的详细实例可以在下文实施例中找到。
制造本发明化合物的其它方法
本发明化合物的可药用酸加成盐可以通过使化合物的游离碱形式与可药用的无机或有机酸反应来制备。或者，本发明化合物的可药用碱加成盐可以通过使化合物的游离酸形式与可药用的无机或有机碱反应来制备。
或者，本发明化合物的盐形式可以使用起始原料或中间体的盐来制备。
本发明化合物的游离酸或游离碱形式可以分别由相应的碱加成盐或酸加成盐来制备。例如酸加成盐形式的本发明化合物可以通过用适宜的碱(如氢氧化铵溶液、氢氧化钠等等)处理转化成相应的游离碱。碱加成盐形式的本发明化合物可以通过用适宜的酸(如盐酸等)处理转化成相应的游离酸。
未氧化形式的本发明化合物可以由本发明化合物的N-氧化物在0℃至80℃下在适宜惰性有机溶剂(如乙腈、乙醇、二噁烷水溶液等)中通过用还原剂(如硫、二氧化硫、三苯膦、硼氢化锂、硼氢化钠、三氯化磷、三溴化磷等等)处理来制备。
本发明化合物的前药衍生物可以通过本领域普通技术人员已知的方法来制备(如，进一步的细节参见Saulnier等人，(1994)，Bioorganic andMedicinal Chemistry Letters，第4卷，第1985页)。例如，适当的前药可以通过使非衍生化的本发明化合物与适宜的氨甲酰化剂(如1，1-酰氧基烷基羰基氯(carbanochloridate)、对硝基苯基碳酸酯等)反应来制备。
本发明化合物的被保护的衍生物可以通过本领域普通技术人员已知的方法来制备。可用于建立保护基团以及除去它们的技术的详细描述可参见T.W.Greene的《有机化学中的保护基》(“Protecting Groups in OrganicChemistry”，第三版，约翰·威利公司(John Wiley and Sons，Inc.)，1999)。
在本发明的方法中可以方便地制备或形成本发明化合物的溶剂化物(如水合物)。本发明化合物的水合物可通过采用有机溶剂如二氧芑、四氢呋喃或甲醇在水/有机溶剂混合物中重结晶来方便地制备。
还可如下制备本发明化合物的单一立体异构体：使化合物的外消旋混合物与旋光活性的拆分试剂反应，形成一对非对映异构化合物，分离非对映异构体并回收旋光纯的对映异构体。当对映异构体的拆分可采用本发明化合物的共价非对映异构衍生物进行时，优选可解离的复合物(如非对映异构的盐结晶)。非对映异构体具有不同的物理性质(如熔点、沸点、溶解性、反应活性等)，可以利用这些不同点来容易地加以分离。非对映异构体可以通过色谱法来分离，或优选通过基于溶解性差异的分离/拆分技术来分离。然后通过任何不会导致外消旋化的实用方法回收旋光纯的对映异构体和拆分试剂。可用于从化合物的外消旋混合物中拆分其立体异构体的技术在Jean Jacques、Andre Collet和Samuel H.Wilen的《对映异构体、外消旋物和拆分》(“Enantiomers，Racemates and Resolutions”，约翰·威利公司(John Wiley and Sons，Inc.)，1981)中有更详细的描述。
总的来说，式I化合物可以通过涉及以下步骤的方法来制备：
(a)反应流程图I的步骤；及
(b)任选将本发明的化合物转化为可药用盐；
(c)任选将本发明化合物的盐形式转化为非盐形式；
(d)任选将本发明化合物的非氧化形式转化为可药用的N-氧化物；
(e)任选将本发明化合物的N-氧化物形式转化为其非氧化形式。
(f)任选从异构体混合物中拆分出本发明化合物的单一异构体；
(g)任选将非衍生化的本发明化合物转化为可药用的前药衍生物；和
(h)任选将本发明化合物的前药衍生物转化为其非衍生化形式。
关于起始原料的生产没有具体描述，这些化合物是已知的，或者可类似于本领域公知的方法或在下文实施例中公开的方法来制备。
本领域技术人员可以理解：上述转化仅仅是本发明化合物的制备方法的代表性方法，也可类似地使用其它熟知的方法。
实施例
本发明还通过下列阐述本发明的式I化合物的制备的实施例进一步被举例，但不局限于此。
实施例1
1-[4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基]-3-(3-三氟甲基-苯基)-脲(4)的合成

4-(4-硝基-苯氧基)-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶：

向溶于DMF(60ml)中的4-氯-7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶(3.1g，20mmol)溶液中加入4-硝基苯酚(4.9g，35mmol)和碳酸钾(5.3g，38mmol)。将所得溶液于110℃加热过夜。在通过原料消失判断反应完全后，将反应混合物冷却至环境温度，倒入冷水中。过滤收集所得固体，用水洗涤(3×100ml)。将粗品采用己烷∶乙酸乙酯(1/1v/v)作为洗脱剂经快速柱色谱法纯化，得到标题化合物，为固体：¹H NMR 400MHz(DMSO-d₆)δ12.34(bs，1H)，8.35(m，3H)，7.57(m，3H)，6.61(m，1H)；HRMS(MALDI-FTMS)C₁₂H₉N₄O₃[MH]⁺：计算值257.0669，实测值257.0670。
4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基胺

采用本领域已知的方法，通过还原相应的硝基获得该化合物：MS m/z227.1(M+1)。
1-[4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基]-3-(3-三氟甲基苯基)-脲

向3-(三氟甲基)苯胺(0.013ml，1mmol)在二氯甲烷(2ml)中的溶液中加入氯甲酸4-硝基苯基酯(0.020ml，1mmol)和吡啶(0.008ml，1mmol)。将反应混合物搅拌5分钟，然后加入4(0.018g，0.78mmol)和N，N-二异丙基乙基胺(0.134ml，0.78mmol)。将所得反应物于环境温度搅拌1小时，此后LC-MS分析显示3消失。真空除去溶剂，将所得残余物溶于DMSO(1ml)中。将所得溶液经反相LC-MS纯化，得到标题化合物，为三氟乙酸盐：¹H NMR400MHz(DMSO-d₆)δ12.19(s，1H)，8.98(s，1H)，9.1(s，1H)，8.91(s，1H)，8.28(s，1H)，8.01(s，1H)，7.58(m，1H)，7.52(d，J＝8.8Hz，2H)，7.51-7.50(m，1H)，7.43(t，J＝2.8Hz，1H)，7.31(d，J＝8.0Hz，1H)，7.18(d，J＝8.8Hz，1H)，6.42(m，1H)；HRMS(MALDI-FTMS)，C₂₀H₁₅F₃N₅O₂[MH]⁺计算值414.1172，实测值414.1169。
实施例2
N-[4-(7H-吡咯并[2，3-d]嘧啶-4-基氧基)-苯基]-2-(3-三氟甲基-苯基)-乙酰胺的合成

向3(0.020g，0.088mmol)、(3-三氟甲基-苯基)-乙酸(0.020g，0.10mmol)和N，N-二异丙基乙基胺(17.2μl，0.1mmol)在二甲基甲酰胺(0.5ml)中的溶液中加入O-(7-氮杂苯并三唑-1-基)-N，N，N’，N’-四甲基脲鎓六氟磷酸盐(0.036g，0.096mmol)。于环境温度搅拌1小时后，将粗的反应混合物在乙酸乙酯和水之间分配。分离有机层，经无水硫酸钠干燥，过滤，真空浓缩，得到粗品。将残余物溶于DMSO(1ml)中，将所得溶液经反相LC-MS纯化，得到标题化合物，为三氟乙酸盐：¹H NMR 400MHz(DMSO-d₆)δ12.13(bs，1H)，10.38(bs，1H)，8.27(s，1H)，7.71(s，1H)，7.6-7.66(m，5H)，7.43(m，1H)，7.19(d，J＝9.2Hz，2H)，6.41(m，1H)3.82(s，2H)；HRMS(MALDI-FTMS)C₂₁H₁₆F₃N₄O₂[MH]+计算值413.1220，实测值413.1222。
重复以上实施例中所描述的操作，使用合适的起始原料，获得如表1中所确定的下列式I化合物。
表1




分析
对本发明的化合物进行分析，以测定它们与亲本32D细胞相比选择性抑制表达BCR-Abl的32D细胞(32D-p210)增殖的能力。测试选择性抑制这些BCR-Abl转化细胞增殖的化合物对表达野生型或突变形式的BCR-Abl的Ba/F3细胞的抗增殖能力。另外，对本发明的化合物进行分析，以测定它们抑制Abl、Bcr-Abl、Aurora-A、Axl、BMX、CHK2、c-RAF、cSRC、Fes、FGFR3、Flt3、IKKα、IR、JNK2α2、Lck、Met、MKK6、MST2、p70S6K、PDGFRα、PKA、PKD2、ROCK-II、Ros、Rsk1、SAPK2α、SAPK2β、SAPK3、SAPK4、Syk、Tie2和TrkB激酶的能力。
BCR-Abl依赖性细胞增殖的抑制(高流通量法)
所用鼠细胞系是用BCR-Abl cDNA转化的32D造血祖细胞系(32D-p210)。这些细胞维持在补充有50μg/ml青霉素、50μg/ml链霉素和200mM L-谷氨酰胺的RPMI/10％胎牛血清(RPMI/FCS)中。未经转化的32D细胞添加15％WEHI条件培养基作为IL-3来源而类似地维持。
将50μl 32D或32D-p210细胞混悬液铺在Greiner 384孔微板(黑)中，密度为5000个细胞/孔。每孔加入50μl测试化合物(1mM，DMSO储备液)(包括作为阳性对照的STI571)。细胞在37℃、5％二氧化碳条件下孵育72小时。每孔加入10μl 60％Alamar Blue溶液(泰克诊断公司(Tekdiagnostics))，细胞另外孵育24小时。使用Acquest^TM系统(分子装置公司(Molecular Devices))对荧光强度(激发波长530nm，发射波长580nm)进行定量。
BCR-Abl依赖性细胞增殖的抑制
将32D-p210细胞铺在96孔TC板中，密度为15000个细胞/每孔。每孔加入50μl测试化合物的两倍系列稀释液(C_max为40μM)(包括作为阳性对照的STI571)。细胞在37℃、5％二氧化碳条件下孵育48小时后，每孔加入15μl MTT(普洛麦格(Promega)公司)，细胞另外孵育5小时。采用分光光度法对570nm处的光密度进行定量，IC₅₀值，即50％抑制所需的化合物浓度，由剂量-反应曲线确定。
对细胞周期分布的作用
将32D或32D-p210细胞铺在6孔TC板中，每孔5ml培养基、2.5×10⁶个细胞，加入1或10μM测试化合物(包括作为对照的STI571)。继而将细胞在37℃、5％二氧化碳条件下孵育24或48小时。取2ml细胞混悬液用PBS洗涤，在70％乙醇中固定1小时，并用PBS/EDTA/RNase A处理30分钟。加入碘化丙啶(Cf＝10μg/ml)，使用FACScalibur^TM系统(碧迪生物科学公司(BD Biosciences))以流式细胞法对荧光强度进行定量。本发明的测试化合物证明对32D-p210细胞有凋亡作用，但不诱导32D亲本细胞凋亡。
对细胞BCR-Abl自磷酸化的作用
BCR-Abl自磷酸化使用c-abl特异性捕获抗体和抗磷酸酪氨酸抗体通过捕获ELISA进行定量。将32D-p210细胞铺在96孔TC板中，每孔2×10⁵个细胞、50μl培养基。每孔加入50μl测试化合物的两倍系列稀释液(C_max为10μM)(包括作为阳性对照的STI571)。细胞在37℃、5％二氧化碳条件下孵育90分钟。继而将细胞用150μl含有蛋白水解酶和磷酸酶抑制剂的溶解缓冲液(50mM Tris-HCl(pH7.4)，150mM NaCl，5mM EDTA，1mMEGTA和1％NP-40)在冰上处理1小时。将50μl细胞溶解物加入预先涂有抗abl特异性抗体并封闭的96孔光学板(optiplate)中。将板在4℃孵育4小时。用TBS-吐温20缓冲液洗涤后，加入50μl碱性磷酸酶结合的抗磷酸酪氨酸抗体，将板进一步在4℃孵育过夜。用TBS-吐温20缓冲液洗涤后，加入90μl发光底物，采用Acquest^TM系统(分子装置公司(MolecularDevices))对发光强度进行定量。本发明的抑制表达BCR-Abl的细胞增殖的测试化合物以剂量依赖的方式抑制细胞BCR-Abl自磷酸化。
对表达BCR-Abl突变形式的细胞的增殖的作用
测试本发明化合物对表达野生型或突变形式的BCR-Abl(G250E、E225V、T315I、F317L、M351T)(使得对STI571耐药或敏感性较低)的Ba/F3细胞的抗增殖作用。如上所述(在不含IL3的培养基中)，在10、3.3、1.1和0.37μM浓度测试这些化合物对表达BCR-Abl突变体的细胞和对未转化细胞的抗增殖作用。由如上所述获得的剂量-响应曲线，确定了对未转化细胞无毒性的化合物的IC₅₀值。
FGFR3(酶测定法)
利用纯化FGFR3(Upstate)进行激酶活性测定，最终体积为10μL，其中含有0.25μg/mL酶的激酶缓冲溶液(30mM Tris-HCl pH7.5，15mMMgCl₂，4.5mM MnCl₂，15μM Na₃VO₄和50μg/mL BSA)和底物(5μg/mL生物素-聚-EY(Glu，Tyr)(CIS-US公司)和3μM ATP)。制备两种溶液：将5μL第一种溶液(含有在激酶缓冲液中的FGFR3酶)首先分配在384-格式ProxiPlate(珀金埃尔默公司(PerkinElmer))中，然后加入50nL化合物的DMSO溶液，然后向每孔加入5μL第二种溶液，其中含有在激酶缓冲液中的底物(聚-EY)和ATP。将反应物于室温温育1小时，加入10μL HTRF检测混合物终止反应，所述混合物含有30mM Tris-HCl pH7.5、0.5M KF、50mM ETDA、0.2mg/mL BSA、15μg/mL链霉抗生物素-XL665(CIS-US公司)和150ng/mL穴状化合物缀合的抗-磷酸酪氨酸抗体(CIS-US公司)。于室温温育1小时以允许链霉抗生物素-生物素相互作用后，在Analyst GT(分子装置公司(Molecular Devices Corp.))上读取时间分辨荧光信号。通过对每种化合物在12种浓度(从50μM按1∶3稀释至0.28nM)下的抑制百分比进行线性回归分析，计算得IC₅₀值。在本测定法中，本发明化合物的IC₅₀范围为10nM至2μM。
FGFR3(细胞测定法)
测试本发明化合物抑制转化Ba/F3-TEL-FGFR3细胞增殖的能力，这种增殖依赖于FGFR3细胞激酶活性。将Ba/F3-TEL-FGFR3在用作培养基的补充有10％胎牛血清的RPMI 1640中培养至800,000细胞/mL混悬液。将50μL细胞培养基混悬液分配在384-孔格式平板中，密度为5000个细胞/孔。将本发明化合物溶解和稀释在二甲基亚砜(DMSO)中。在DMSO中进行十二点1∶3系列稀释，所得浓度梯度通常从10mM至0.05μM。向细胞加入50nL稀释化合物，在细胞培养温育器中温育48小时。向细胞加入最终浓度为10％的AlamarBlue(特克诊断系统公司(TREK DiagnosticSystems))，其可用于监测由增殖细胞所产生的还原性环境。在37℃细胞培养温育器中温育另外4小时后，在Analyst GT(分子装置公司(MolecularDevices Corp.))上对来自被还原的AlamarBlue的荧光信号(激发波长530nm，发射波长580nm)进行定量。通过对每种化合物在12种浓度下的抑制百分比进行线性回归分析，计算得IC₅₀值。
FLT3和PDGFRβ(细胞测定法)
利用与上述FGFR3细胞活性所述相同的方法，除了分别使用Ba/F3-FLT3-ITD和Ba/F3-Tel-PDGFRβ代替Ba/F3-TEL-FGFR3，测定本发明化合物对FLT3和PDGFRβ细胞活性的作用。
b-Raf-酶测定法
测试本发明化合物抑制b-RAF活性的能力。在黑色壁和透明底的384孔MaxiSorp板(NUNC)中进行测定。在DPBS中稀释底物IκBα(1∶750)并在各孔中加入15μL。在4℃下将板培养过夜并采用EMBLA板洗涤器、用TBST(25mM Tris，pH8.0，150mM NaCl和0.05％吐温-20)洗涤3次。在室温下，将板用Superblock(15μL/孔)封闭3小时，用TBST洗涤3次并拍干(pat-dried)。将含有20μM ATP(10μL)的测定缓冲液加到各孔中，然后加入100nL或500nL化合物。将B-RAF在测定缓冲液中稀释(1μL稀释至25μl)中并将10μl稀释的B-RAF加到各孔中(0.4μg/孔)。在室温下将该板培养2.5小时。通过用TBST洗涤该板6次来终止激酶反应。在Superblock中稀释Phosph-IκBα(Ser32/36)抗体(1∶10,000)并将15μL加到各孔中。将板在4℃下培养过夜并用TBST洗涤6次。在Superblock中稀释AP-结合的羊-抗-鼠IgG(1∶1,500)并将15μL加到各孔中。在室温下培养该板1小时并用TBST洗涤6次。在各孔中加入15μL Attophos AP荧光底物(普洛麦格(Promega)公司)并在室温下培养15分钟。在Acquest或Analyst GT上采用荧光强度程序读板(激发波长455nm，发射波长580nm)。
b-Raf-细胞测定法
在A375细胞中测试本发明化合物抑制MEK磷酸化的能力。A375细胞系(ATCC)衍生自人黑素瘤患者，它在B-Raf基因上具有V599E突变。由于B-Raf突变，磷酸化MEK的水平上升。在没有血清的介质中，于37℃将亚汇合到汇合的A375细胞与化合物一起培养2小时。然后用冷PBS洗涤细胞一次，用含有1％TritonX100的细胞溶解缓冲液裂解细胞。离心后，上层液用SDS-PAGE处理，然后转移到硝基纤维素膜上。将膜用抗-磷酸-MEK抗体(ser217/221)(细胞信号传导公司(Cell Signaling))进行蛋白质印迹。通过硝基纤维素膜上磷酸-MEK带的密度监测磷酸化MEK的量。
采用SYBR Green I的抗疟疾分析
可以分析本发明的化合物以测定它们抑制受感染的红血细胞中血寄生虫(parasitemia)增殖的能力。增殖通过加入对双链DNA具有高亲和性的SYBR Green I(英杰(Invitrogen)公司)染料来定量。
对于药物筛选，将不含有人血清的20μl筛选培养基分配至3块分析板中。然后将50nl各本发明的化合物、包括抗疟疾对照(氯奎和artimesinin)转移至分析板中。将50nl DMSO转移至基线和本底对照板。然后将混悬在筛选培养基中的、被恶性疟原虫感染的人红血细胞的混悬液30μl分配在分析板和基线对照板中，以便最终血细胞比容为2.5％且最终血寄生虫为3％。将未受感染的红血细胞分配在本底对照板中，以便最终血细胞比容为2.5％。将板在具有93％N₂、4％CO₂和3％O₂气体混合物的37℃培养箱中放置72小时。将10μl SYBR Green I10X溶液分配在板中。将板密封，于-80℃冷冻箱中放置过夜以供分析红血细胞。将板熔融化，于释放放置过夜以供最佳染色。采用Acquest系统(分子装置公司(Molecular Devices))测定荧光强度(激发波长497nm，发射波长520nm)。计算每种化合物的抑制百分比。
Upstate KinaseProfiler^TM-放射酶滤膜结合分析
评价本发明的化合物抑制激酶名单中单个成员的能力。按这类方案以终浓度为10μM对化合物进行测试，一式两份。注意，激酶缓冲组合物和底物对于“Upstate KinaseProfiler^TM”名单中所包括的不同激酶是不同的。在冰上，将激酶缓冲液(2.5μl，10×，需要时含有MnCl₂)、活性激酶(0.001-0.01单位；2.5μL)、在激酶缓冲液中的特异性或聚(Glu4-Tyr)肽(5-500μM或0.1mg/ml)以及激酶缓冲液(50μM；5μl)在艾本德(eppendorf)管中混合。加入Mg/ATP混合液(10μL；67.5(或33.75)mM MgCl₂，450(或225)μM ATP和1μCi/μl[γ-³²P]-ATP(3000Ci/mmol))，反应物在30℃孵育约10分钟。将反应混合物在2cm×2cm P81(磷酸纤维素，用于带正电荷的肽底物)或Whatman 1号(用于聚(Glu4-Tyr)肽底物)的正方形纸上点样。用于分析的正方形纸用0.75％磷酸洗涤4次，每次5分钟，并用丙酮冲洗一次(5分钟)。将正方形纸移入闪烁小瓶中，加入5ml闪烁合剂，掺入肽底物的³²P(cpm)用Beckman闪烁计数器进行定量。计算每个反应的抑制百分率。
游离形式或可药用盐形式的式I化合物显示出有价值的药理性质，例如在本申请中所描述的体外试验所显示的那样。例如，对于野生型BCR-Abl和G250E、E255V、T315I、F317L和M351T BCR-Abl突变体而言，优选式I化合物的IC₅₀为1×10^-10至1×10^-5M，优选低于500nM、250nM、100nM和50nM。
10μM浓度的式I化合物优选显示出高于50％、优选高于约70％的对抗Abl、Bcr-Abl、Aurora-A、Axl、BMX、CHK2、c-RAF、cSRC、Fes、FGFR3、Flt3、IKKα、IR、JNK2α2、Lck、Met、MKK6、MST2、p70S6K、PDGFRα、PKA、PKD2、ROCK-II、Ros、Rsk1、SAPK2α、SAPK2β、SAPK3、SAPK4、Syk、Tie2和TrkB激酶的抑制百分比。
应当理解，本文所述的实施例和实施方案仅仅用于解释说明的目的，它们的各种变通或变化方法将提示给本领域技术人员，并且被包括在本申请的宗旨和范围以及所附权利要求的范围内。本文引用的所有出版物、专利和专利申请引入本文作为所有目的的参考。